98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1444 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1444  DNA polymerase B region  100 
 
 		 562 aa  1144    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2300  DNA polymerase B region  54.46 
 
 		 552 aa  631  1e-179  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  30.29 
 
 		 723 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1185  DNA polymerase I  28.57 
 
 		 657 aa  154  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000674312  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1253  DNA polymerase I  33.78 
 
 		 679 aa  151  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0839  DNA polymerase I  30.52 
 
 		 655 aa  146  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3264  DNA polymerase I  29.48 
 
 		 716 aa  134  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1891  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 768 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  27.41 
 
 		 785 aa  105  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  28.27 
 
 		 783 aa  105  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  26.8 
 
 		 784 aa  101  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  25.87 
 
 		 780 aa  99.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  25.51 
 
 		 786 aa  97.8  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  27.88 
 
 		 853 aa  96.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  24.83 
 
 		 780 aa  94.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  27.14 
 
 		 853 aa  94.4  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  27.88 
 
 		 854 aa  94  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  27.04 
 
 		 854 aa  93.2  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  35.37 
 
 		 783 aa  90.9  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  26.43 
 
 		 852 aa  90.9  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  28.74 
 
 		 794 aa  90.5  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  24.04 
 
 		 781 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  26.18 
 
 		 781 aa  84  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  24.22 
 
 		 810 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  23.9 
 
 		 871 aa  82.4  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  22.32 
 
 		 811 aa  77  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  25.82 
 
 		 607 aa  76.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  25.37 
 
 		 877 aa  75.5  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  23.42 
 
 		 882 aa  76.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  25.29 
 
 		 835 aa  75.1  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  31.29 
 
 		 1459 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  26.63 
 
 		 784 aa  68.2  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  32.12 
 
 		 1463 aa  68.2  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  26.67 
 
 		 1485 aa  65.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  27.09 
 
 		 982 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  29.07 
 
 		 941 aa  62.4  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  27.33 
 
 		 990 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5509  DNA-directed DNA polymerase B  23.86 
 
 		 603 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  28.08 
 
 		 932 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  23.81 
 
 		 818 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  23.21 
 
 		 795 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  24.5 
 
 		 788 aa  52  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  25.17 
 
 		 820 aa  51.6  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  21.19 
 
 		 790 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  25.97 
 
 		 786 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  23.38 
 
 		 787 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  26.38 
 
 		 793 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  23.68 
 
 		 795 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  25 
 
 		 788 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  24.86 
 
 		 782 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  23.49 
 
 		 1044 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  23.53 
 
 		 794 aa  48.9  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  21.57 
 
 		 786 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  23.33 
 
 		 786 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  23.23 
 
 		 789 aa  47.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  23.71 
 
 		 1070 aa  47.4  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  23.23 
 
 		 789 aa  47.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  23.23 
 
 		 789 aa  47.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  23.33 
 
 		 786 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  24.36 
 
 		 791 aa  47  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  25.17 
 
 		 1058 aa  47.4  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  24.68 
 
 		 792 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  26.45 
 
 		 791 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  23.68 
 
 		 792 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  25.48 
 
 		 910 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  24.26 
 
 		 810 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  26.45 
 
 		 816 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  24.46 
 
 		 797 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  23.67 
 
 		 810 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  25.15 
 
 		 809 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  24.85 
 
 		 789 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  22.01 
 
 		 790 aa  45.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  24.68 
 
 		 786 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  25.16 
 
 		 807 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  25.9 
 
 		 787 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  23.67 
 
 		 810 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  24.52 
 
 		 783 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  24.5 
 
 		 783 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  24.52 
 
 		 783 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  24.52 
 
 		 783 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  24.5 
 
 		 783 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  24.5 
 
 		 783 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  25.17 
 
 		 788 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  24.5 
 
 		 783 aa  44.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  24.5 
 
 		 783 aa  44.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  24.52 
 
 		 783 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  24.5 
 
 		 783 aa  44.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  24.5 
 
 		 783 aa  44.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  24.5 
 
 		 783 aa  44.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  24.5 
 
 		 783 aa  44.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  24.54 
 
 		 809 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  24.54 
 
 		 809 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  24.54 
 
 		 809 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  24.26 
 
 		 788 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0081  DNA polymerase I-like  22.98 
 
 		 311 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  22.64 
 
 		 790 aa  43.5  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  23.51 
 
 		 1087 aa  43.5  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0696  DNA polymerase B region  26.9 
 
 		 742 aa  43.5  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000163547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>