28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1643 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1643  exonuclease  100 
 
 
287 aa  588  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  39.23 
 
 
272 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0916  hypothetical protein  35.82 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.58478  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1492  hypothetical protein  35.89 
 
 
277 aa  195  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000942268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2938  hypothetical protein  36.4 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  38.52 
 
 
277 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1749  hypothetical protein  34.55 
 
 
249 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.873614  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  33.2 
 
 
253 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4347  hypothetical protein  31.78 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4215  hypothetical protein  31.4 
 
 
267 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4370  hypothetical protein  31.01 
 
 
267 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  32.67 
 
 
250 aa  142  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1783  hypothetical protein  31.49 
 
 
254 aa  136  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4364  hypothetical protein  31.4 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015731  normal  0.163667 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1716  hypothetical protein  30.08 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  31.05 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1001  hypothetical protein  30.21 
 
 
249 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  35.06 
 
 
164 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  34.19 
 
 
165 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  35.26 
 
 
165 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  32.9 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  33.11 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  31.13 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2632  exonuclease-like protein  31.79 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2961  exonuclease-like protein  31.37 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0548295  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0078  DNA polymerase I-like  31.65 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1330  exonuclease-like protein  35.48 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000156681  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  23.08 
 
 
361 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>