29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1330 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1330  exonuclease-like protein  100 
 
 
392 aa  804    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000156681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14620  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.76 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00393571  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  29.63 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2252  hypothetical protein  30.21 
 
 
362 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.207907  normal  0.25741 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  27.72 
 
 
253 aa  60.5  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0079  hypothetical protein  25.6 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.418653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0433  exonuclease-like protein  26.35 
 
 
423 aa  56.2  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  26.77 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0672  hypothetical protein  28.93 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1749  hypothetical protein  27.69 
 
 
249 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.873614  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1909  hypothetical protein  30.41 
 
 
421 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000148245  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03332  hypothetical protein  29.94 
 
 
606 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0078  DNA polymerase I-like  33.71 
 
 
265 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1643  exonuclease  35.48 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0923  exonuclease-like protein  30.37 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000308008  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  24.58 
 
 
272 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0995  exonuclease-like protein  25.2 
 
 
385 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  26.85 
 
 
780 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  21.94 
 
 
414 aa  46.2  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0279  hypothetical protein  34.09 
 
 
361 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  28.7 
 
 
810 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  28 
 
 
162 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  28.5 
 
 
165 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2938  hypothetical protein  32.26 
 
 
277 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131158 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  36 
 
 
811 aa  43.5  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2376  hypothetical protein  27.56 
 
 
421 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1068  DNA polymerase III, epsilon chain  25.52 
 
 
277 aa  43.5  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  28.68 
 
 
250 aa  43.5  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  25.85 
 
 
277 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>