32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1186 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  340  5e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  93.21 
 
 		 162 aa  318  3e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  89.7 
 
 		 165 aa  310  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  59.49 
 
 		 164 aa  186  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2961  exonuclease-like protein  46.15 
 
 		 182 aa  133  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0548295  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  45.51 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  44.03 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2632  exonuclease-like protein  46.54 
 
 		 168 aa  117  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1783  hypothetical protein  38.46 
 
 		 254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  35.47 
 
 		 251 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  38.31 
 
 		 250 aa  105  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1716  hypothetical protein  37.74 
 
 		 250 aa  104  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  45.45 
 
 		 277 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1001  hypothetical protein  38.96 
 
 		 249 aa  101  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  42.68 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1749  hypothetical protein  40.65 
 
 		 249 aa  96.3  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.873614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  38.51 
 
 		 272 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0916  hypothetical protein  42.86 
 
 		 281 aa  93.6  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.58478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1492  hypothetical protein  42.21 
 
 		 277 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000942268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2938  hypothetical protein  38.96 
 
 		 277 aa  84.3  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131158 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1643  exonuclease  35.26 
 
 		 287 aa  77.8  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4347  hypothetical protein  31.1 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4370  hypothetical protein  31.1 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4215  hypothetical protein  31.1 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4364  hypothetical protein  31.9 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015731  normal  0.163667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2219  exonuclease-like protein  30.06 
 
 		 386 aa  50.8  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0078  DNA polymerase I-like  27.21 
 
 		 265 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  23.16 
 
 		 361 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1330  exonuclease-like protein  28.5 
 
 		 392 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000156681  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  28 
 
 		 290 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0279  hypothetical protein  28.45 
 
 		 361 aa  42.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14620  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.12 
 
 		 406 aa  40.4  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00393571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>