33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3041 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  100 
 
 		 168 aa  337  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2632  exonuclease-like protein  80.95 
 
 		 168 aa  259  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  65.81 
 
 		 168 aa  208  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2961  exonuclease-like protein  59.18 
 
 		 182 aa  171  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0548295  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  49.04 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  44.03 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  44.65 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  44.03 
 
 		 165 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  39.61 
 
 		 253 aa  96.3  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  37.25 
 
 		 250 aa  93.2  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1783  hypothetical protein  37.16 
 
 		 254 aa  93.2  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1749  hypothetical protein  38.46 
 
 		 249 aa  91.3  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.873614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4347  hypothetical protein  39.86 
 
 		 267 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4364  hypothetical protein  41.22 
 
 		 301 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015731  normal  0.163667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  39.33 
 
 		 277 aa  89  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4370  hypothetical protein  39.19 
 
 		 267 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4215  hypothetical protein  39.19 
 
 		 267 aa  87.8  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1716  hypothetical protein  37.75 
 
 		 250 aa  87.4  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  40.71 
 
 		 251 aa  85.9  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  40.67 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0916  hypothetical protein  38.67 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.58478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1492  hypothetical protein  36 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000942268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2938  hypothetical protein  36 
 
 		 277 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131158 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1001  hypothetical protein  33.55 
 
 		 249 aa  74.7  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1643  exonuclease  31.13 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0079  hypothetical protein  33.05 
 
 		 340 aa  54.3  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.418653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  34.43 
 
 		 414 aa  53.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2219  exonuclease-like protein  29.88 
 
 		 386 aa  50.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03332  hypothetical protein  31.25 
 
 		 606 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  28.99 
 
 		 361 aa  44.3  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  32.73 
 
 		 290 aa  44.3  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0433  exonuclease-like protein  32.08 
 
 		 423 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0279  hypothetical protein  29.63 
 
 		 361 aa  41.2  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>