42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1702 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  567  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  48.28 
 
 		 414 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14620  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.19 
 
 		 406 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00393571  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0079  hypothetical protein  41.77 
 
 		 340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.418653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03332  hypothetical protein  45.76 
 
 		 606 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2376  hypothetical protein  35.81 
 
 		 421 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  32.8 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1909  hypothetical protein  34.4 
 
 		 421 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000148245  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0433  exonuclease-like protein  37.02 
 
 		 423 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2252  hypothetical protein  31.72 
 
 		 362 aa  96.3  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.207907  normal  0.25741 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0995  exonuclease-like protein  29.71 
 
 		 385 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2219  exonuclease-like protein  34.46 
 
 		 386 aa  92.8  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0279  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  90.5  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1330  exonuclease-like protein  26.92 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000156681  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0672  hypothetical protein  35.92 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  31.61 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  29.07 
 
 		 277 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  27.98 
 
 		 165 aa  53.1  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  27.27 
 
 		 250 aa  52.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  28.03 
 
 		 810 aa  52.4  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  28.14 
 
 		 165 aa  52.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  27.54 
 
 		 162 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  25.6 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  24.39 
 
 		 781 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  35.54 
 
 		 168 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1492  hypothetical protein  30.9 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000942268  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  26.19 
 
 		 780 aa  49.3  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  25.76 
 
 		 780 aa  49.3  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  33.62 
 
 		 168 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0916  hypothetical protein  27.98 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.58478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1749  hypothetical protein  23.98 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.873614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1783  hypothetical protein  30.95 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  30.18 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  24.4 
 
 		 164 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2632  exonuclease-like protein  30.17 
 
 		 168 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0923  exonuclease-like protein  25.82 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000308008  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1716  hypothetical protein  26.82 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2961  exonuclease-like protein  29.75 
 
 		 182 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0548295  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0517  hypothetical protein  30.77 
 
 		 261 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0078  DNA polymerase I-like  27.27 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  25.71 
 
 		 852 aa  42.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1001  hypothetical protein  36.25 
 
 		 249 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>