30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1492 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1492  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  570  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000942268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2938  hypothetical protein  56.04 
 
 
277 aa  293  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131158 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  57.09 
 
 
272 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0916  hypothetical protein  48.54 
 
 
281 aa  266  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.58478  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  48.35 
 
 
277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1643  exonuclease  35.89 
 
 
287 aa  195  6e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  39.29 
 
 
253 aa  192  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1749  hypothetical protein  37.7 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.873614  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  40.42 
 
 
250 aa  168  9e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1716  hypothetical protein  40.48 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  38.8 
 
 
251 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1783  hypothetical protein  40.08 
 
 
254 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1001  hypothetical protein  39.42 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4364  hypothetical protein  41.15 
 
 
301 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015731  normal  0.163667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4215  hypothetical protein  36.51 
 
 
267 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4370  hypothetical protein  36.1 
 
 
267 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4347  hypothetical protein  35.68 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  41.56 
 
 
165 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  42.21 
 
 
165 aa  93.2  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  40.26 
 
 
162 aa  92  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  36.31 
 
 
164 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2632  exonuclease-like protein  38 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  36 
 
 
168 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  34.64 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2961  exonuclease-like protein  34 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0548295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  30 
 
 
414 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2376  hypothetical protein  33.04 
 
 
421 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  31.62 
 
 
290 aa  43.5  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2219  exonuclease-like protein  24.9 
 
 
386 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14620  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.14 
 
 
406 aa  42.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00393571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>