35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0377 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  100 
 
 		 277 aa  578  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0916  hypothetical protein  55.11 
 
 		 281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.58478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1492  hypothetical protein  48.35 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000942268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2938  hypothetical protein  46.18 
 
 		 277 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131158 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  46.32 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  43.32 
 
 		 253 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1749  hypothetical protein  41.25 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.873614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1643  exonuclease  38.52 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4370  hypothetical protein  35.66 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4215  hypothetical protein  34.88 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4347  hypothetical protein  34.88 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  36.75 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1716  hypothetical protein  36.69 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4364  hypothetical protein  36.43 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015731  normal  0.163667 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1783  hypothetical protein  34.62 
 
 		 254 aa  148  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1001  hypothetical protein  35.34 
 
 		 249 aa  142  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  34.47 
 
 		 251 aa  141  9e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  46.1 
 
 		 165 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  44.81 
 
 		 162 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  45.45 
 
 		 165 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  43.14 
 
 		 164 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  39.33 
 
 		 168 aa  89  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2632  exonuclease-like protein  39.33 
 
 		 168 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  40.27 
 
 		 168 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2961  exonuclease-like protein  33.12 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0548295  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0433  exonuclease-like protein  29.07 
 
 		 423 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  30.65 
 
 		 414 aa  50.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  27.59 
 
 		 361 aa  48.9  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2376  hypothetical protein  30.41 
 
 		 421 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  29.31 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2219  exonuclease-like protein  30.3 
 
 		 386 aa  45.8  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1909  hypothetical protein  27.72 
 
 		 421 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000148245  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03332  hypothetical protein  28.03 
 
 		 606 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2252  hypothetical protein  26.9 
 
 		 362 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.207907  normal  0.25741 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1330  exonuclease-like protein  25.85 
 
 		 392 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000156681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>