23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2252 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2252  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  742    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.207907  normal  0.25741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0279  hypothetical protein  43.28 
 
 		 361 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  38.08 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2219  exonuclease-like protein  39.63 
 
 		 386 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0672  hypothetical protein  41.3 
 
 		 297 aa  126  7e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0995  exonuclease-like protein  33.33 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2376  hypothetical protein  34.12 
 
 		 421 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1909  hypothetical protein  30.89 
 
 		 421 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000148245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14620  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.74 
 
 		 406 aa  89.4  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00393571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0433  exonuclease-like protein  30.37 
 
 		 423 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0079  hypothetical protein  33.85 
 
 		 340 aa  86.7  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.418653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03332  hypothetical protein  34.91 
 
 		 606 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  33.76 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  32.5 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1330  exonuclease-like protein  30.21 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000156681  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0923  exonuclease-like protein  27.93 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000308008  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  28.47 
 
 		 1442 aa  48.5  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  25 
 
 		 574 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  28.75 
 
 		 168 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  32.39 
 
 		 810 aa  43.9  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  28.77 
 
 		 574 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  26.9 
 
 		 277 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4215  hypothetical protein  26.48 
 
 		 267 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>