18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2376 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2376  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  859    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1909  hypothetical protein  62.5 
 
 
421 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000148245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14620  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.7 
 
 
406 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00393571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0433  exonuclease-like protein  30.67 
 
 
423 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  35.42 
 
 
414 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2219  exonuclease-like protein  38.42 
 
 
386 aa  114  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  34.24 
 
 
361 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0279  hypothetical protein  36.51 
 
 
361 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2252  hypothetical protein  34.12 
 
 
362 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.207907  normal  0.25741 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0995  exonuclease-like protein  27.49 
 
 
385 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0079  hypothetical protein  37.91 
 
 
340 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.418653 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  37.24 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03332  hypothetical protein  35.96 
 
 
606 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0672  hypothetical protein  35.54 
 
 
297 aa  53.1  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  30.41 
 
 
277 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1492  hypothetical protein  33.04 
 
 
277 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000942268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1330  exonuclease-like protein  27.56 
 
 
392 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000156681  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  28.24 
 
 
272 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>