21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03332 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03332  hypothetical protein  100 
 
 
606 aa  1196    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0079  hypothetical protein  62.2 
 
 
340 aa  359  8e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.418653 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14620  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.04 
 
 
406 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00393571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  41.18 
 
 
414 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  46.2 
 
 
290 aa  118  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1909  hypothetical protein  37.64 
 
 
421 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000148245  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  34.04 
 
 
361 aa  104  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2376  hypothetical protein  35.96 
 
 
421 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2252  hypothetical protein  34.91 
 
 
362 aa  94  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.207907  normal  0.25741 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0433  exonuclease-like protein  36.5 
 
 
423 aa  93.2  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2219  exonuclease-like protein  34.81 
 
 
386 aa  83.2  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0279  hypothetical protein  30.11 
 
 
361 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0995  exonuclease-like protein  29.34 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1330  exonuclease-like protein  29.94 
 
 
392 aa  66.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000156681  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0672  hypothetical protein  31.03 
 
 
297 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  31.25 
 
 
168 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  32.76 
 
 
168 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  28.49 
 
 
165 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  25.28 
 
 
253 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  27.47 
 
 
250 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  26.23 
 
 
277 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>