33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1404 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  342  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  89.7 
 
 
165 aa  310  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  90.12 
 
 
162 aa  307  4e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  60.13 
 
 
164 aa  186  9e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2961  exonuclease-like protein  46.15 
 
 
182 aa  135  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0548295  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  45.28 
 
 
168 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2632  exonuclease-like protein  47.8 
 
 
168 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  44.65 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1783  hypothetical protein  37.82 
 
 
254 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  34.88 
 
 
251 aa  105  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  46.1 
 
 
277 aa  104  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  36.54 
 
 
250 aa  103  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  42.04 
 
 
253 aa  99.4  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1001  hypothetical protein  37.82 
 
 
249 aa  99.4  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0916  hypothetical protein  43.51 
 
 
281 aa  97.1  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.58478  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1716  hypothetical protein  35.22 
 
 
250 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1749  hypothetical protein  40 
 
 
249 aa  95.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.873614  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  37.89 
 
 
272 aa  94.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1492  hypothetical protein  41.56 
 
 
277 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000942268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2938  hypothetical protein  40.26 
 
 
277 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131158 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1643  exonuclease  34.19 
 
 
287 aa  78.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4364  hypothetical protein  33.13 
 
 
301 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015731  normal  0.163667 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4347  hypothetical protein  35.67 
 
 
267 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4370  hypothetical protein  35.67 
 
 
267 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4215  hypothetical protein  35.67 
 
 
267 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105075  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2219  exonuclease-like protein  25.57 
 
 
386 aa  47.4  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  28.57 
 
 
290 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0078  DNA polymerase I-like  34.29 
 
 
265 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  23.16 
 
 
361 aa  44.7  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  29.17 
 
 
204 aa  42  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03332  hypothetical protein  29.08 
 
 
606 aa  41.6  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0279  hypothetical protein  28.95 
 
 
361 aa  41.2  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  25.37 
 
 
414 aa  40.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>