34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2219 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2219  exonuclease-like protein  100 
 
 		 386 aa  755    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0279  hypothetical protein  49.54 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  44.7 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2252  hypothetical protein  39.63 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.207907  normal  0.25741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2376  hypothetical protein  38.42 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1909  hypothetical protein  35.16 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000148245  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0672  hypothetical protein  36.56 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0995  exonuclease-like protein  36.36 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14620  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.71 
 
 		 406 aa  99.8  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00393571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  35.29 
 
 		 414 aa  87  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  35.62 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03332  hypothetical protein  35.91 
 
 		 606 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0079  hypothetical protein  34.62 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.418653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0433  exonuclease-like protein  31.98 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  28.4 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  35.29 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  27.68 
 
 		 165 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1716  hypothetical protein  27.27 
 
 		 250 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  27.84 
 
 		 162 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  29.88 
 
 		 168 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  26.97 
 
 		 165 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0923  exonuclease-like protein  25.97 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000308008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  31.52 
 
 		 277 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1330  exonuclease-like protein  23.96 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000156681  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  26.97 
 
 		 272 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2632  exonuclease-like protein  30.3 
 
 		 168 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1492  hypothetical protein  25.61 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000942268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  26.67 
 
 		 164 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1001  hypothetical protein  24.1 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0916  hypothetical protein  25.95 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.58478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  25.1 
 
 		 253 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2829  hypothetical protein  31.76 
 
 		 269 aa  43.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2451  hypothetical protein  31.76 
 
 		 277 aa  43.1  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  normal  0.370864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>