25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0916 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0916  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  578  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.58478  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  55.11 
 
 
277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1492  hypothetical protein  48.54 
 
 
277 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000942268  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  47.21 
 
 
272 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2938  hypothetical protein  48.47 
 
 
277 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1749  hypothetical protein  42.92 
 
 
249 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.873614  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1643  exonuclease  35.82 
 
 
287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  40 
 
 
253 aa  193  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1783  hypothetical protein  38.03 
 
 
254 aa  163  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  37.45 
 
 
250 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1716  hypothetical protein  36.47 
 
 
250 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1001  hypothetical protein  37.18 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  35.17 
 
 
251 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4364  hypothetical protein  37.89 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015731  normal  0.163667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4215  hypothetical protein  35.25 
 
 
267 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4370  hypothetical protein  35.25 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4347  hypothetical protein  35.14 
 
 
267 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  42.86 
 
 
162 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  43.51 
 
 
165 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  42.86 
 
 
165 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  41.18 
 
 
164 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2632  exonuclease-like protein  42 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  38.67 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  40 
 
 
168 aa  79  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2961  exonuclease-like protein  38.22 
 
 
182 aa  79  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0548295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>