37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1457 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1783  hypothetical protein  63.41 
 
 
254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  60.33 
 
 
250 aa  306  3e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1001  hypothetical protein  65.99 
 
 
249 aa  305  6e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1716  hypothetical protein  58.23 
 
 
250 aa  301  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1749  hypothetical protein  41.8 
 
 
249 aa  192  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.873614  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  37.96 
 
 
253 aa  185  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1492  hypothetical protein  38.8 
 
 
277 aa  158  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000942268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2938  hypothetical protein  38.82 
 
 
277 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0916  hypothetical protein  35.17 
 
 
281 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.58478  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  34.47 
 
 
277 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  35.97 
 
 
272 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1643  exonuclease  31.05 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4215  hypothetical protein  34.51 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4347  hypothetical protein  34.51 
 
 
267 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4370  hypothetical protein  34.12 
 
 
267 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4364  hypothetical protein  36.59 
 
 
301 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015731  normal  0.163667 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  37.58 
 
 
162 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  35.47 
 
 
165 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  34.88 
 
 
165 aa  105  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  33.97 
 
 
164 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2961  exonuclease-like protein  35.33 
 
 
182 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0548295  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2632  exonuclease-like protein  39.35 
 
 
168 aa  89  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  40.71 
 
 
168 aa  85.9  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  34.23 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  27.59 
 
 
361 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0517  hypothetical protein  30.28 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  33.33 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  33.05 
 
 
414 aa  52.4  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0433  exonuclease-like protein  28.98 
 
 
423 aa  52.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2219  exonuclease-like protein  25 
 
 
386 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0672  hypothetical protein  24.37 
 
 
297 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  28.57 
 
 
209 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  29.7 
 
 
209 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  29.02 
 
 
209 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  32.86 
 
 
550 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14620  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 
406 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00393571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>