25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4370 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4370  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  521  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4215  hypothetical protein  97.75 
 
 
267 aa  510  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4347  hypothetical protein  97.75 
 
 
267 aa  511  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4364  hypothetical protein  71.54 
 
 
301 aa  355  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015731  normal  0.163667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  35.66 
 
 
277 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1749  hypothetical protein  33.74 
 
 
249 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.873614  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  31.71 
 
 
253 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  38.04 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1643  exonuclease  31.01 
 
 
287 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2938  hypothetical protein  34.1 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0916  hypothetical protein  35.25 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.58478  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1492  hypothetical protein  36.1 
 
 
277 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000942268  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1783  hypothetical protein  36.02 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1716  hypothetical protein  34.82 
 
 
250 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  32.79 
 
 
250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  34.12 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1001  hypothetical protein  33.46 
 
 
249 aa  115  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  39.19 
 
 
168 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  36.73 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2632  exonuclease-like protein  36.05 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2961  exonuclease-like protein  33.79 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0548295  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  32.9 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  33.76 
 
 
162 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  35.67 
 
 
165 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  31.1 
 
 
165 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>