71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2829 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2451  hypothetical protein  99.63 
 
 		 277 aa  551  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2829  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0800  hypothetical protein  58.04 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1360  hypothetical protein  50.99 
 
 		 256 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1364  hypothetical protein  50.59 
 
 		 256 aa  268  5e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1101  hypothetical protein  52.53 
 
 		 261 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1353  hypothetical protein  53.03 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0029  hypothetical protein  50.59 
 
 		 257 aa  259  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0589  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  51.35 
 
 		 268 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0488742 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2217  hypothetical protein  48.66 
 
 		 267 aa  248  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.392582  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1852  hypothetical protein  48.84 
 
 		 258 aa  248  8e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0971  hypothetical protein  48.65 
 
 		 267 aa  248  8e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5120  3'-5' exonuclease  49.02 
 
 		 258 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.015476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3027  propable PolB  48.85 
 
 		 262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1454  3'-5' exonuclease  49.8 
 
 		 258 aa  244  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133375  normal  0.401434 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1730  3'-5' exonuclease  49.41 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0609431  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1757  3'-5' exonuclease  49.8 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6260  3'-5' exonuclease  52.59 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1819  3'-5' exonuclease  52.59 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2349  putative 3'-5' exonuclease  51.29 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.948558  normal  0.0792646 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1843  3'-5' exonuclease  52.16 
 
 		 258 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.0685914 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2197  hypothetical protein  48.44 
 
 		 258 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2227  hypothetical protein  48.05 
 
 		 258 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2235  hypothetical protein  48.05 
 
 		 258 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1115  hypothetical protein  48.05 
 
 		 258 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2364  propable polB  48.05 
 
 		 258 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1843  hypothetical protein  48.05 
 
 		 258 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0963  3'-5' exonuclease  49.22 
 
 		 258 aa  241  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188043  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1353  hypothetical protein  48.05 
 
 		 258 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0220984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0054  hypothetical protein  48.05 
 
 		 258 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289194  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1288  propable PolB  48.29 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.671751  normal  0.251577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1838  putative 3'-5' exonuclease  51.07 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376243  normal  0.478604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2114  hypothetical protein  51.85 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0931649  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2094  hypothetical protein  50.62 
 
 		 278 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1296  3'-5' exonuclease  45.45 
 
 		 273 aa  228  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276744  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0744  hypothetical protein  35.06 
 
 		 273 aa  165  8e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.133036  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0549  hypothetical protein  34.43 
 
 		 275 aa  165  8e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.215773  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0477  hypothetical protein  34.78 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0385  hypothetical protein  37.84 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000693475  unclonable  0.000000000422197 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0735  hypothetical protein  35.23 
 
 		 272 aa  155  9e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0589  polysaccharide biosynthesis protein  36.07 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.92996  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0469  large-conductance mechanosensitive channel  39.06 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000368758  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0345  hypothetical protein  37.64 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0379  hypothetical protein  38.43 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1274  polysaccharide biosynthesis protein  34.65 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.349568  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1149  polysaccharide biosynthesis protein  34.65 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.803914  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1800  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  38.43 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1227  polysaccharide biosynthesis protein  34.98 
 
 		 343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.750362  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1398  hypothetical protein  36.18 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.54759  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1248  conserved hypothetical protein, putative polysaccharide biosynthesis protein  33.48 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.813451  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0781  polysaccharide biosynthesis protein  30.31 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0522762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7600  hypothetical protein  33.46 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5692  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  33.74 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224827  normal  0.358759 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5668  hypothetical protein  37.84 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2589  hypothetical protein  31.73 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2267  hypothetical protein  29.32 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3646  hypothetical protein  27.47 
 
 		 283 aa  90.5  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.59355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2926  hypothetical protein  33.47 
 
 		 271 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3021  hypothetical protein  33.47 
 
 		 271 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2837  hypothetical protein  32.22 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2768  hypothetical protein  32.76 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.941783 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0041  hypothetical protein  31.44 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.4713  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1083  hypothetical protein  23.93 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00230373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3714  hypothetical protein  26.47 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1688  hypothetical protein  28.08 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03580  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.789751  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1631  hypothetical protein  26.27 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000204525  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5509  DNA-directed DNA polymerase B  31.13 
 
 		 603 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26262 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0078  DNA polymerase I-like  31.87 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0137  hypothetical protein  22.36 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  30.56 
 
 		 361 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>