68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0041 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0041  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  572  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.4713  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1227  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.750362  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0469  large-conductance mechanosensitive channel  33.62 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000368758  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1800  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  34.47 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0781  polysaccharide biosynthesis protein  31.4 
 
 		 310 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0522762  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1398  hypothetical protein  29.23 
 
 		 272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.54759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1852  hypothetical protein  32.7 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0379  hypothetical protein  29.55 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1296  3'-5' exonuclease  31.09 
 
 		 273 aa  112  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276744  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1115  hypothetical protein  32.95 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0735  hypothetical protein  31.82 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2235  hypothetical protein  32.95 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2364  propable polB  32.95 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2197  hypothetical protein  32.95 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0054  hypothetical protein  32.95 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1843  hypothetical protein  32.95 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0345  hypothetical protein  29.92 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1353  hypothetical protein  32.95 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0220984  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2227  hypothetical protein  32.56 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0800  hypothetical protein  33.46 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0385  hypothetical protein  29.82 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000693475  unclonable  0.000000000422197 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2217  hypothetical protein  32.58 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.392582  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3027  propable PolB  32.96 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1288  propable PolB  31.2 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.671751  normal  0.251577 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1454  3'-5' exonuclease  32.03 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133375  normal  0.401434 
 
 
-
 
NC_002978  WD0744  hypothetical protein  31.58 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.133036  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1274  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.349568  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1149  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.803914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1730  3'-5' exonuclease  32.57 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0609431  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1843  3'-5' exonuclease  34.96 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.0685914 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1819  3'-5' exonuclease  34.96 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538856  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6260  3'-5' exonuclease  34.96 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0589  polysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.92996  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1248  conserved hypothetical protein, putative polysaccharide biosynthesis protein  31.7 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.813451  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0963  3'-5' exonuclease  31.64 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1757  3'-5' exonuclease  32.18 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5120  3'-5' exonuclease  32.18 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.015476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1353  hypothetical protein  30.57 
 
 		 263 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1838  putative 3'-5' exonuclease  32.56 
 
 		 258 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376243  normal  0.478604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2349  putative 3'-5' exonuclease  32.56 
 
 		 258 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.948558  normal  0.0792646 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2114  hypothetical protein  32.91 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0931649  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1364  hypothetical protein  30.12 
 
 		 256 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1360  hypothetical protein  30.52 
 
 		 256 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1101  hypothetical protein  35.06 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5692  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  34.22 
 
 		 241 aa  99.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224827  normal  0.358759 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2837  hypothetical protein  27.78 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0029  hypothetical protein  30.45 
 
 		 257 aa  96.3  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0971  hypothetical protein  30.7 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3021  hypothetical protein  28.07 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2926  hypothetical protein  28.07 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2094  hypothetical protein  29.5 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5668  hypothetical protein  25.65 
 
 		 349 aa  92  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0477  hypothetical protein  29.3 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0549  hypothetical protein  29.41 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.215773  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0589  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  36.75 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0488742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2768  hypothetical protein  31.33 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.941783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7600  hypothetical protein  24.63 
 
 		 281 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2589  hypothetical protein  28.18 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2451  hypothetical protein  31.88 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2829  hypothetical protein  31.44 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2267  hypothetical protein  34.78 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3646  hypothetical protein  26.99 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.59355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03580  polysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.789751  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1631  hypothetical protein  30.77 
 
 		 229 aa  45.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000204525  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1083  hypothetical protein  31.3 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00230373  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1688  hypothetical protein  26.58 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0137  hypothetical protein  30.51 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2857  hypothetical protein  30.77 
 
 		 200 aa  42  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.550879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>