67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3714 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3714  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  508  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5874  hypothetical protein  44 
 
 		 245 aa  224  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0137  hypothetical protein  46.78 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03580  polysaccharide biosynthesis protein  48.87 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.789751  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0877  hypothetical protein  45.92 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6525  hypothetical protein  45.61 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1083  hypothetical protein  45.45 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00230373  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1274  polysaccharide biosynthesis protein  31.08 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.349568  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0589  polysaccharide biosynthesis protein  31.08 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.92996  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1149  polysaccharide biosynthesis protein  31.08 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.803914  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2364  propable polB  30 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1843  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0054  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2197  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2235  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1115  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1296  3'-5' exonuclease  30.2 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276744  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1227  polysaccharide biosynthesis protein  29.22 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.750362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1353  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0220984  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2227  hypothetical protein  29.38 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1800  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  29.41 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1454  3'-5' exonuclease  29.38 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133375  normal  0.401434 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1398  hypothetical protein  26.2 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.54759  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0781  polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 		 310 aa  57  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0522762  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1248  conserved hypothetical protein, putative polysaccharide biosynthesis protein  31.97 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.813451  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0469  large-conductance mechanosensitive channel  29.03 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000368758  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1757  3'-5' exonuclease  28.75 
 
 		 258 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1838  putative 3'-5' exonuclease  29.38 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376243  normal  0.478604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2349  putative 3'-5' exonuclease  30 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.948558  normal  0.0792646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2094  hypothetical protein  28.3 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1730  3'-5' exonuclease  28.12 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0609431  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1819  3'-5' exonuclease  28.12 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538856  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6260  3'-5' exonuclease  28.12 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1843  3'-5' exonuclease  28.12 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.0685914 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5120  3'-5' exonuclease  27.5 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.015476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2114  hypothetical protein  27.85 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0931649  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2217  hypothetical protein  26.78 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.392582  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1688  hypothetical protein  25.42 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0963  3'-5' exonuclease  27.5 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188043  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1360  hypothetical protein  27.78 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1353  hypothetical protein  25.2 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2768  hypothetical protein  26.91 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.941783 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0345  hypothetical protein  24.41 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1101  hypothetical protein  29.79 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0379  hypothetical protein  24.38 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1364  hypothetical protein  27.08 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0800  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0971  hypothetical protein  27.27 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2837  hypothetical protein  30.4 
 
 		 292 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2926  hypothetical protein  25 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2451  hypothetical protein  26.77 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3021  hypothetical protein  25 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39902  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1852  hypothetical protein  26.45 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0549  hypothetical protein  29.13 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.215773  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2829  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0589  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  27.16 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0488742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0029  hypothetical protein  23.63 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3027  propable PolB  26.38 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1288  propable PolB  24.53 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.671751  normal  0.251577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5692  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  30.53 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224827  normal  0.358759 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0477  hypothetical protein  29.13 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5668  hypothetical protein  28.19 
 
 		 349 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2589  hypothetical protein  29.37 
 
 		 325 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1631  hypothetical protein  22.87 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000204525  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0744  hypothetical protein  27.07 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.133036  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0385  hypothetical protein  22.81 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000693475  unclonable  0.000000000422197 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2857  hypothetical protein  22.39 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.550879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>