70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1288 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1288  propable PolB  100 
 
 		 261 aa  539  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.671751  normal  0.251577 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3027  propable PolB  74.81 
 
 		 262 aa  408  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2227  hypothetical protein  66.15 
 
 		 258 aa  362  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1843  hypothetical protein  65 
 
 		 258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1353  hypothetical protein  65 
 
 		 258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0220984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0054  hypothetical protein  65 
 
 		 258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1115  hypothetical protein  65 
 
 		 258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2235  hypothetical protein  65 
 
 		 258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2364  propable polB  65 
 
 		 258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2197  hypothetical protein  64.62 
 
 		 258 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2217  hypothetical protein  63.85 
 
 		 267 aa  354  5.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.392582  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0963  3'-5' exonuclease  63.08 
 
 		 258 aa  351  7e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2114  hypothetical protein  63.53 
 
 		 278 aa  350  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0931649  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1852  hypothetical protein  63.98 
 
 		 258 aa  350  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2094  hypothetical protein  61.65 
 
 		 278 aa  341  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1454  3'-5' exonuclease  64.23 
 
 		 258 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133375  normal  0.401434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1838  putative 3'-5' exonuclease  60.77 
 
 		 258 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376243  normal  0.478604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2349  putative 3'-5' exonuclease  60.38 
 
 		 258 aa  335  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.948558  normal  0.0792646 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1296  3'-5' exonuclease  62.08 
 
 		 273 aa  335  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276744  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5120  3'-5' exonuclease  63.08 
 
 		 258 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.015476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6260  3'-5' exonuclease  62.31 
 
 		 258 aa  329  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1819  3'-5' exonuclease  62.31 
 
 		 258 aa  329  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538856  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1843  3'-5' exonuclease  62.31 
 
 		 258 aa  328  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.0685914 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1730  3'-5' exonuclease  61.92 
 
 		 258 aa  328  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0609431  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0971  hypothetical protein  59.39 
 
 		 267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1757  3'-5' exonuclease  61.54 
 
 		 258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1101  hypothetical protein  55.56 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1353  hypothetical protein  57.53 
 
 		 263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0800  hypothetical protein  52.71 
 
 		 257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1360  hypothetical protein  55.46 
 
 		 256 aa  275  7e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1364  hypothetical protein  55.46 
 
 		 256 aa  275  7e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0589  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  51.89 
 
 		 268 aa  271  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0488742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0029  hypothetical protein  48.45 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2829  hypothetical protein  48.29 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2451  hypothetical protein  47.91 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0345  hypothetical protein  37.36 
 
 		 271 aa  176  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0385  hypothetical protein  35.09 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000693475  unclonable  0.000000000422197 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0379  hypothetical protein  35.61 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_002978  WD0744  hypothetical protein  37.3 
 
 		 273 aa  164  9e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.133036  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0477  hypothetical protein  34.8 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0549  hypothetical protein  36.48 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.215773  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1800  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  35.5 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0735  hypothetical protein  36.18 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1248  conserved hypothetical protein, putative polysaccharide biosynthesis protein  31.98 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.813451  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0469  large-conductance mechanosensitive channel  33.6 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000368758  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0589  polysaccharide biosynthesis protein  33.76 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.92996  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1398  hypothetical protein  36.48 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.54759  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1274  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 264 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.349568  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1149  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.803914  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1227  polysaccharide biosynthesis protein  33.05 
 
 		 343 aa  135  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.750362  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0781  polysaccharide biosynthesis protein  32.58 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0522762  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2267  hypothetical protein  30.74 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5668  hypothetical protein  32.94 
 
 		 349 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2589  hypothetical protein  29.74 
 
 		 325 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7600  hypothetical protein  29.66 
 
 		 281 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0041  hypothetical protein  31.2 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.4713  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3021  hypothetical protein  29.18 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2926  hypothetical protein  29.18 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2837  hypothetical protein  29.53 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3646  hypothetical protein  26.64 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.59355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2768  hypothetical protein  29.66 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.941783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5692  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  31.78 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224827  normal  0.358759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1688  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0137  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1631  hypothetical protein  29.68 
 
 		 229 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000204525  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2857  hypothetical protein  28.95 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.550879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3714  hypothetical protein  24.53 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1083  hypothetical protein  21.46 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00230373  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03067  DNA polymerase epsilon catalytic subunit A (DNA polymerase II subunit A)(EC 2.7.7.7) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O93845]  24.84 
 
 		 2207 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.958905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6525  hypothetical protein  23.5 
 
 		 241 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  normal  0.0969772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>