75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1227 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1227  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 343 aa  708    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.750362  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0469  large-conductance mechanosensitive channel  72.97 
 
 		 336 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000368758  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1398  hypothetical protein  66.17 
 
 		 272 aa  387  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.54759  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1800  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  63.32 
 
 		 262 aa  345  8.999999999999999e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0781  polysaccharide biosynthesis protein  52.77 
 
 		 310 aa  322  7e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0522762  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1274  polysaccharide biosynthesis protein  50.55 
 
 		 264 aa  302  7.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.349568  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0589  polysaccharide biosynthesis protein  50.74 
 
 		 264 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.92996  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1149  polysaccharide biosynthesis protein  50.93 
 
 		 264 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.803914  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1248  conserved hypothetical protein, putative polysaccharide biosynthesis protein  50.19 
 
 		 259 aa  294  1e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.813451  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1364  hypothetical protein  37.25 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1360  hypothetical protein  37.25 
 
 		 256 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0744  hypothetical protein  36.07 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.133036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1101  hypothetical protein  37.5 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0549  hypothetical protein  34.92 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.215773  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0735  hypothetical protein  35.18 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0800  hypothetical protein  36.14 
 
 		 257 aa  159  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1852  hypothetical protein  37.45 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1838  putative 3'-5' exonuclease  36.63 
 
 		 258 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376243  normal  0.478604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2217  hypothetical protein  37.34 
 
 		 267 aa  157  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.392582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1843  3'-5' exonuclease  37.04 
 
 		 258 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.0685914 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2227  hypothetical protein  36.05 
 
 		 258 aa  155  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2349  putative 3'-5' exonuclease  37.3 
 
 		 258 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.948558  normal  0.0792646 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1115  hypothetical protein  36.48 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2235  hypothetical protein  36.48 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0054  hypothetical protein  36.48 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1843  hypothetical protein  36.48 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1819  3'-5' exonuclease  36.48 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2364  propable polB  36.48 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1757  3'-5' exonuclease  36.48 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6260  3'-5' exonuclease  36.48 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5120  3'-5' exonuclease  36.48 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.015476  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1353  hypothetical protein  36.48 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0220984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2197  hypothetical protein  36.48 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1730  3'-5' exonuclease  36.07 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0609431  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1296  3'-5' exonuclease  34.8 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276744  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0379  hypothetical protein  35.63 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0963  3'-5' exonuclease  35.41 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0477  hypothetical protein  36.22 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0345  hypothetical protein  34.78 
 
 		 271 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2114  hypothetical protein  35.46 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0931649  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1454  3'-5' exonuclease  36.36 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133375  normal  0.401434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3027  propable PolB  34.41 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0029  hypothetical protein  38.7 
 
 		 257 aa  149  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1353  hypothetical protein  33.59 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0971  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  147  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2094  hypothetical protein  33.86 
 
 		 278 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0589  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  32.71 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0488742 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0385  hypothetical protein  32.28 
 
 		 269 aa  143  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000693475  unclonable  0.000000000422197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1288  propable PolB  33.05 
 
 		 261 aa  135  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.671751  normal  0.251577 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2451  hypothetical protein  34.98 
 
 		 277 aa  133  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2829  hypothetical protein  34.98 
 
 		 269 aa  133  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0041  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.4713  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5668  hypothetical protein  28.63 
 
 		 349 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5692  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  32.23 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224827  normal  0.358759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7600  hypothetical protein  29.6 
 
 		 281 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2589  hypothetical protein  27.17 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2837  hypothetical protein  28.69 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2926  hypothetical protein  27.64 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3021  hypothetical protein  27.64 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39902  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2768  hypothetical protein  29.79 
 
 		 290 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.941783 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2267  hypothetical protein  29.05 
 
 		 281 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3646  hypothetical protein  24 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.59355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3714  hypothetical protein  29.22 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6525  hypothetical protein  27.07 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1688  hypothetical protein  26.81 
 
 		 234 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1083  hypothetical protein  27.53 
 
 		 239 aa  50.1  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00230373  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03580  polysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 		 237 aa  49.3  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.789751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5874  hypothetical protein  25.71 
 
 		 245 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.650646 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03067  DNA polymerase epsilon catalytic subunit A (DNA polymerase II subunit A)(EC 2.7.7.7) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O93845]  28.77 
 
 		 2207 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.958905 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0137  hypothetical protein  26.91 
 
 		 241 aa  48.5  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1631  hypothetical protein  26.71 
 
 		 229 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000204525  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2857  hypothetical protein  26.03 
 
 		 200 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.550879  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  26 
 
 		 1058 aa  43.5  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  25.71 
 
 		 781 aa  43.5  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  27.43 
 
 		 607 aa  42.7  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>