61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2857 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2857  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  416  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.550879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1631  hypothetical protein  79.8 
 
 		 229 aa  327  6e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000204525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7600  hypothetical protein  30.94 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0549  hypothetical protein  28.38 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.215773  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1274  polysaccharide biosynthesis protein  27.34 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.349568  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0589  polysaccharide biosynthesis protein  28.06 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.92996  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1149  polysaccharide biosynthesis protein  27.34 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.803914  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0744  hypothetical protein  28.37 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.133036  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0477  hypothetical protein  28.87 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1248  conserved hypothetical protein, putative polysaccharide biosynthesis protein  30.5 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.813451  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03580  polysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.789751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2217  hypothetical protein  29.8 
 
 		 267 aa  53.9  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.392582  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5692  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  31.75 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224827  normal  0.358759 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0735  hypothetical protein  29.08 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1296  3'-5' exonuclease  26.92 
 
 		 273 aa  52.8  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276744  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2589  hypothetical protein  33.85 
 
 		 325 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6525  hypothetical protein  27.87 
 
 		 241 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1083  hypothetical protein  26.01 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00230373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0800  hypothetical protein  26.39 
 
 		 257 aa  51.6  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0877  hypothetical protein  34.26 
 
 		 237 aa  51.6  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1101  hypothetical protein  27.75 
 
 		 261 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0971  hypothetical protein  26.62 
 
 		 267 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1353  hypothetical protein  27.23 
 
 		 263 aa  48.9  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5668  hypothetical protein  31.34 
 
 		 349 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1852  hypothetical protein  31.16 
 
 		 258 aa  48.9  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1353  hypothetical protein  29.61 
 
 		 258 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0220984  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2227  hypothetical protein  29.61 
 
 		 258 aa  48.5  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1843  hypothetical protein  29.61 
 
 		 258 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2364  propable polB  29.61 
 
 		 258 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0054  hypothetical protein  29.61 
 
 		 258 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289194  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2235  hypothetical protein  29.61 
 
 		 258 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1115  hypothetical protein  29.61 
 
 		 258 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0029  hypothetical protein  27.84 
 
 		 257 aa  48.1  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1288  propable PolB  28.95 
 
 		 261 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.671751  normal  0.251577 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2197  hypothetical protein  29.61 
 
 		 258 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1454  3'-5' exonuclease  27.27 
 
 		 258 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133375  normal  0.401434 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1730  3'-5' exonuclease  27.27 
 
 		 258 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0609431  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0137  hypothetical protein  25.49 
 
 		 241 aa  45.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5120  3'-5' exonuclease  26.62 
 
 		 258 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.015476  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1360  hypothetical protein  25.83 
 
 		 256 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0469  large-conductance mechanosensitive channel  25.85 
 
 		 336 aa  45.4  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000368758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1843  3'-5' exonuclease  27.27 
 
 		 258 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.0685914 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0963  3'-5' exonuclease  26.62 
 
 		 258 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1819  3'-5' exonuclease  27.27 
 
 		 258 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538856  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6260  3'-5' exonuclease  27.27 
 
 		 258 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1227  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 		 343 aa  45.1  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.750362  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1838  putative 3'-5' exonuclease  25.97 
 
 		 258 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376243  normal  0.478604 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3021  hypothetical protein  29.23 
 
 		 271 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2926  hypothetical protein  29.23 
 
 		 271 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1688  hypothetical protein  26.62 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2837  hypothetical protein  29.23 
 
 		 292 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0379  hypothetical protein  26.55 
 
 		 271 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1364  hypothetical protein  25.17 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1757  3'-5' exonuclease  26.62 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3027  propable PolB  29.5 
 
 		 262 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2349  putative 3'-5' exonuclease  25.32 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.948558  normal  0.0792646 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0345  hypothetical protein  25.68 
 
 		 271 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3714  hypothetical protein  22.39 
 
 		 244 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2768  hypothetical protein  30.16 
 
 		 290 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.941783 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1398  hypothetical protein  29.75 
 
 		 272 aa  42.4  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.54759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0041  hypothetical protein  30.77 
 
 		 274 aa  42  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.4713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>