72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1688 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1688  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  487  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6525  hypothetical protein  33.09 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1360  hypothetical protein  27.51 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1364  hypothetical protein  26.64 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2197  hypothetical protein  30.4 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0054  hypothetical protein  30.4 
 
 		 258 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1353  hypothetical protein  30.4 
 
 		 258 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0220984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1843  hypothetical protein  30.4 
 
 		 258 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2235  hypothetical protein  30.4 
 
 		 258 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1115  hypothetical protein  30.4 
 
 		 258 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2364  propable polB  30.4 
 
 		 258 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1852  hypothetical protein  34.04 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1838  putative 3'-5' exonuclease  29.2 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376243  normal  0.478604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2114  hypothetical protein  30.74 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0931649  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0963  3'-5' exonuclease  28.38 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2227  hypothetical protein  29.96 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2094  hypothetical protein  30.3 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2349  putative 3'-5' exonuclease  28.76 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.948558  normal  0.0792646 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0477  hypothetical protein  26.58 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1288  propable PolB  28.21 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.671751  normal  0.251577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5120  3'-5' exonuclease  29.39 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.015476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0744  hypothetical protein  25.21 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.133036  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2217  hypothetical protein  28.32 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.392582  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1296  3'-5' exonuclease  28.33 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276744  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1454  3'-5' exonuclease  28.51 
 
 		 258 aa  62  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133375  normal  0.401434 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0589  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  27.85 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0488742 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03580  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.789751  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1730  3'-5' exonuclease  28.51 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0609431  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1843  3'-5' exonuclease  28.51 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.0685914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2768  hypothetical protein  27.96 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.941783 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1083  hypothetical protein  25.99 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00230373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1757  3'-5' exonuclease  28.51 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0735  hypothetical protein  31.11 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0137  hypothetical protein  26.61 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1819  3'-5' exonuclease  28.51 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538856  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6260  3'-5' exonuclease  28.51 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0877  hypothetical protein  26.72 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0469  large-conductance mechanosensitive channel  29.17 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000368758  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3027  propable PolB  28.32 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0549  hypothetical protein  24.26 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.215773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2926  hypothetical protein  26.54 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3021  hypothetical protein  26.54 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1101  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0971  hypothetical protein  25.61 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0029  hypothetical protein  31.88 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2837  hypothetical protein  26.07 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3714  hypothetical protein  25.42 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1800  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  28.68 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0589  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.92996  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0345  hypothetical protein  25.81 
 
 		 271 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1149  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.803914  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1274  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.349568  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0781  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 310 aa  52.4  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0522762  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0379  hypothetical protein  25.52 
 
 		 271 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1353  hypothetical protein  25.65 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1227  polysaccharide biosynthesis protein  26.81 
 
 		 343 aa  50.4  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.750362  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1248  conserved hypothetical protein, putative polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.813451  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0800  hypothetical protein  26.09 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2267  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5874  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5509  DNA-directed DNA polymerase B  22.86 
 
 		 603 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26262 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5668  hypothetical protein  28.57 
 
 		 349 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0385  hypothetical protein  26.22 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000693475  unclonable  0.000000000422197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2589  hypothetical protein  33.64 
 
 		 325 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7600  hypothetical protein  23.61 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5692  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  28.93 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224827  normal  0.358759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0041  hypothetical protein  26.58 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.4713  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2857  hypothetical protein  26.62 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.550879  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  41.3 
 
 		 941 aa  43.5  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.98 
 
 		 1053 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.98 
 
 		 959 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0006  cyclic nucleotide-binding protein  22.94 
 
 		 793 aa  42  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>