59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0877 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0877  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  485  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03580  polysaccharide biosynthesis protein  73.42 
 
 
237 aa  370  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.789751  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1083  hypothetical protein  67.93 
 
 
239 aa  332  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00230373  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6525  hypothetical protein  46.47 
 
 
241 aa  232  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3714  hypothetical protein  45.92 
 
 
244 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0137  hypothetical protein  43.83 
 
 
241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5874  hypothetical protein  38.4 
 
 
245 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1688  hypothetical protein  32.19 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1248  conserved hypothetical protein, putative polysaccharide biosynthesis protein  29.52 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.813451  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1398  hypothetical protein  31.78 
 
 
272 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.54759  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1149  polysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 
264 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.803914  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2589  hypothetical protein  26.25 
 
 
325 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1274  polysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 
264 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.349568  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1631  hypothetical protein  27.35 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000204525  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1353  hypothetical protein  24.15 
 
 
258 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0220984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1115  hypothetical protein  24.15 
 
 
258 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2235  hypothetical protein  24.15 
 
 
258 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2197  hypothetical protein  24.15 
 
 
258 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0054  hypothetical protein  24.15 
 
 
258 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2364  propable polB  24.15 
 
 
258 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1843  hypothetical protein  24.15 
 
 
258 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0589  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
264 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.92996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3021  hypothetical protein  24.03 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2227  hypothetical protein  23.73 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2837  hypothetical protein  24.68 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0735  hypothetical protein  23.89 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2926  hypothetical protein  24.03 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2768  hypothetical protein  25.94 
 
 
290 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.941783 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1800  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  27.13 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3027  propable PolB  23.97 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2094  hypothetical protein  23.9 
 
 
278 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1296  3'-5' exonuclease  24.47 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276744  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2349  putative 3'-5' exonuclease  23.75 
 
 
258 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.948558  normal  0.0792646 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2857  hypothetical protein  34.26 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.550879  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0744  hypothetical protein  27 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.133036  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1852  hypothetical protein  23.21 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1454  3'-5' exonuclease  23.85 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133375  normal  0.401434 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0469  large-conductance mechanosensitive channel  26.27 
 
 
336 aa  50.8  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000368758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0971  hypothetical protein  22.5 
 
 
267 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2114  hypothetical protein  21.58 
 
 
278 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0931649  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0963  3'-5' exonuclease  24.05 
 
 
258 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188043  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0385  hypothetical protein  25.32 
 
 
269 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000693475  unclonable  0.000000000422197 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2217  hypothetical protein  23.36 
 
 
267 aa  48.9  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.392582  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2267  hypothetical protein  26.07 
 
 
281 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0549  hypothetical protein  26.69 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.215773  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0781  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 
310 aa  45.8  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0522762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5692  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  22.64 
 
 
241 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224827  normal  0.358759 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0433  exonuclease-like protein  28.92 
 
 
423 aa  45.1  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5668  hypothetical protein  26.06 
 
 
349 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5120  3'-5' exonuclease  22.08 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.015476  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1819  3'-5' exonuclease  22.92 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538856  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6260  3'-5' exonuclease  22.92 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1227  polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 
343 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.750362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1730  3'-5' exonuclease  22.92 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0609431  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1843  3'-5' exonuclease  22.92 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.0685914 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1757  3'-5' exonuclease  22.5 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0029  hypothetical protein  22.27 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0477  hypothetical protein  24.79 
 
 
275 aa  43.1  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1101  hypothetical protein  22.78 
 
 
261 aa  42  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>