70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3021 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3021  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2926  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2837  hypothetical protein  98.15 
 
 
292 aa  520  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2768  hypothetical protein  79.32 
 
 
290 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.941783 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1274  polysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.349568  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1149  polysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.803914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0589  polysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 
264 aa  125  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.92996  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0971  hypothetical protein  35.34 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2227  hypothetical protein  33.87 
 
 
258 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1248  conserved hypothetical protein, putative polysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 
259 aa  118  9e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.813451  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1838  putative 3'-5' exonuclease  33.87 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376243  normal  0.478604 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1115  hypothetical protein  33.47 
 
 
258 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2235  hypothetical protein  33.47 
 
 
258 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0054  hypothetical protein  33.47 
 
 
258 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1843  hypothetical protein  33.47 
 
 
258 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2349  putative 3'-5' exonuclease  33.87 
 
 
258 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.948558  normal  0.0792646 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2364  propable polB  33.47 
 
 
258 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1353  hypothetical protein  33.47 
 
 
258 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0220984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2197  hypothetical protein  33.47 
 
 
258 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1800  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  30.33 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0963  3'-5' exonuclease  32.8 
 
 
258 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188043  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2094  hypothetical protein  32.58 
 
 
278 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2114  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0931649  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0469  large-conductance mechanosensitive channel  28.92 
 
 
336 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000368758  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1852  hypothetical protein  34.27 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1730  3'-5' exonuclease  33.87 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0609431  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1757  3'-5' exonuclease  33.87 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1454  3'-5' exonuclease  34 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133375  normal  0.401434 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1819  3'-5' exonuclease  33.87 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538856  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6260  3'-5' exonuclease  33.87 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1843  3'-5' exonuclease  33.87 
 
 
258 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.0685914 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1296  3'-5' exonuclease  32.03 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276744  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0781  polysaccharide biosynthesis protein  28.23 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0522762  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5120  3'-5' exonuclease  31.85 
 
 
258 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.015476  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1227  polysaccharide biosynthesis protein  27.64 
 
 
343 aa  105  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.750362  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3027  propable PolB  31.25 
 
 
262 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0800  hypothetical protein  31.73 
 
 
257 aa  102  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2217  hypothetical protein  32.79 
 
 
267 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.392582  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1288  propable PolB  29.18 
 
 
261 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.671751  normal  0.251577 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1398  hypothetical protein  27.46 
 
 
272 aa  99.8  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.54759  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1364  hypothetical protein  28.23 
 
 
256 aa  99  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1360  hypothetical protein  28.23 
 
 
256 aa  98.6  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0029  hypothetical protein  33.84 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1353  hypothetical protein  34.15 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0041  hypothetical protein  28.07 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.4713  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0735  hypothetical protein  24.69 
 
 
272 aa  92.8  5e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1101  hypothetical protein  32.91 
 
 
261 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5692  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  33.33 
 
 
241 aa  92.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224827  normal  0.358759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7600  hypothetical protein  29.97 
 
 
281 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0744  hypothetical protein  24.48 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.133036  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5668  hypothetical protein  32.04 
 
 
349 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0477  hypothetical protein  24.49 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0549  hypothetical protein  24.29 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.215773  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2589  hypothetical protein  30.21 
 
 
325 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0589  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  30.47 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0488742 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0345  hypothetical protein  26.37 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0379  hypothetical protein  24.91 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2829  hypothetical protein  33.47 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2451  hypothetical protein  33.05 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2267  hypothetical protein  32.85 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0385  hypothetical protein  23.22 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000693475  unclonable  0.000000000422197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3646  hypothetical protein  27.71 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.59355  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1083  hypothetical protein  36.13 
 
 
239 aa  58.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00230373  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03580  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.789751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0137  hypothetical protein  33.6 
 
 
241 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1688  hypothetical protein  26.54 
 
 
234 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0877  hypothetical protein  23.35 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1631  hypothetical protein  32.06 
 
 
229 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000204525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3714  hypothetical protein  25 
 
 
244 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2857  hypothetical protein  29.23 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.550879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>