64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2267 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2267  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  578  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3646  hypothetical protein  43.66 
 
 		 283 aa  253  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.59355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0589  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  33.96 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0488742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1353  hypothetical protein  33.95 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0029  hypothetical protein  32.34 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1101  hypothetical protein  32.33 
 
 		 261 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1288  propable PolB  30.74 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.671751  normal  0.251577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0800  hypothetical protein  32.1 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3027  propable PolB  30.63 
 
 		 262 aa  118  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1296  3'-5' exonuclease  30.27 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276744  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1364  hypothetical protein  29.43 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1360  hypothetical protein  29.43 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0744  hypothetical protein  27.46 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.133036  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1852  hypothetical protein  28.84 
 
 		 258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2114  hypothetical protein  30.16 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0931649  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2094  hypothetical protein  30.16 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2217  hypothetical protein  29.32 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.392582  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0735  hypothetical protein  29.7 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0971  hypothetical protein  31.09 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0477  hypothetical protein  27.01 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0549  hypothetical protein  27.37 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.215773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0963  3'-5' exonuclease  30 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2349  putative 3'-5' exonuclease  30.59 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.948558  normal  0.0792646 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0589  polysaccharide biosynthesis protein  30.51 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.92996  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1149  polysaccharide biosynthesis protein  30.08 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.803914  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1838  putative 3'-5' exonuclease  30.4 
 
 		 258 aa  99  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376243  normal  0.478604 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0469  large-conductance mechanosensitive channel  29.46 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000368758  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1115  hypothetical protein  29.2 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2235  hypothetical protein  29.2 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295108  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1274  polysaccharide biosynthesis protein  30.08 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.349568  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0054  hypothetical protein  29.2 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2364  propable polB  29.2 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2227  hypothetical protein  29.2 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1843  hypothetical protein  29.2 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1353  hypothetical protein  29.2 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0220984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2197  hypothetical protein  28.8 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0385  hypothetical protein  26.98 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000693475  unclonable  0.000000000422197 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1800  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  28.93 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5120  3'-5' exonuclease  31.23 
 
 		 258 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.015476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0379  hypothetical protein  28.57 
 
 		 271 aa  92.8  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1248  conserved hypothetical protein, putative polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.813451  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0345  hypothetical protein  28.21 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1227  polysaccharide biosynthesis protein  29.05 
 
 		 343 aa  90.9  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.750362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1730  3'-5' exonuclease  30.59 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0609431  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6260  3'-5' exonuclease  30.59 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1454  3'-5' exonuclease  29.2 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133375  normal  0.401434 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1819  3'-5' exonuclease  30.59 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1757  3'-5' exonuclease  30.2 
 
 		 258 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1843  3'-5' exonuclease  30.43 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.0685914 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1398  hypothetical protein  27.87 
 
 		 272 aa  87.4  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.54759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2451  hypothetical protein  29.54 
 
 		 277 aa  86.3  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2829  hypothetical protein  29.32 
 
 		 269 aa  85.9  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7600  hypothetical protein  28.62 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2589  hypothetical protein  32.4 
 
 		 325 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5668  hypothetical protein  28.12 
 
 		 349 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0781  polysaccharide biosynthesis protein  30.69 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0522762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2837  hypothetical protein  32.85 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3021  hypothetical protein  32.85 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2926  hypothetical protein  32.85 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0041  hypothetical protein  34.78 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.4713  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2768  hypothetical protein  27.85 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.941783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5692  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  27.06 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224827  normal  0.358759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1688  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0877  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>