67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7600 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7600  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  587  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2589  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  269  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5668  hypothetical protein  47.62 
 
 
349 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0549  hypothetical protein  37.92 
 
 
275 aa  185  9e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.215773  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0477  hypothetical protein  38.11 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0744  hypothetical protein  35.85 
 
 
273 aa  183  3e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.133036  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0735  hypothetical protein  32.58 
 
 
272 aa  155  9e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0469  large-conductance mechanosensitive channel  31.67 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000368758  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1360  hypothetical protein  31.4 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1398  hypothetical protein  29.21 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.54759  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1353  hypothetical protein  33.58 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1364  hypothetical protein  31.01 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1101  hypothetical protein  34.07 
 
 
261 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0029  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1227  polysaccharide biosynthesis protein  29.6 
 
 
343 aa  124  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.750362  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1800  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  28.46 
 
 
262 aa  122  7e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3027  propable PolB  31.25 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0800  hypothetical protein  33.49 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1852  hypothetical protein  33.58 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1248  conserved hypothetical protein, putative polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.813451  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0589  polysaccharide biosynthesis protein  27.31 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.92996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2094  hypothetical protein  32.77 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2217  hypothetical protein  30.68 
 
 
267 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.392582  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2114  hypothetical protein  32.34 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0931649  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1454  3'-5' exonuclease  31.44 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133375  normal  0.401434 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1274  polysaccharide biosynthesis protein  27.92 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.349568  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1149  polysaccharide biosynthesis protein  27.92 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.803914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0963  3'-5' exonuclease  31.82 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188043  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2227  hypothetical protein  29.64 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0971  hypothetical protein  32.08 
 
 
267 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1115  hypothetical protein  29.64 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2197  hypothetical protein  29.64 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2235  hypothetical protein  29.64 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1843  hypothetical protein  29.64 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2364  propable polB  29.64 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0054  hypothetical protein  29.64 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1353  hypothetical protein  29.64 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0220984  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2451  hypothetical protein  33.45 
 
 
277 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1819  3'-5' exonuclease  33.7 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538856  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6260  3'-5' exonuclease  33.7 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2829  hypothetical protein  33.46 
 
 
269 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1843  3'-5' exonuclease  33.7 
 
 
258 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.0685914 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1730  3'-5' exonuclease  30.3 
 
 
258 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0609431  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2349  putative 3'-5' exonuclease  30.3 
 
 
258 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.948558  normal  0.0792646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5120  3'-5' exonuclease  29.92 
 
 
258 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.015476  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1296  3'-5' exonuclease  29.81 
 
 
273 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276744  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1757  3'-5' exonuclease  30.3 
 
 
258 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1838  putative 3'-5' exonuclease  30.3 
 
 
258 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376243  normal  0.478604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1288  propable PolB  29.66 
 
 
261 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.671751  normal  0.251577 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0385  hypothetical protein  34.59 
 
 
269 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000693475  unclonable  0.000000000422197 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0781  polysaccharide biosynthesis protein  27.85 
 
 
310 aa  102  9e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0522762  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0345  hypothetical protein  32.45 
 
 
271 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0379  hypothetical protein  36.73 
 
 
271 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0589  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  33.15 
 
 
268 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0488742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5692  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  29.87 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224827  normal  0.358759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2926  hypothetical protein  29.97 
 
 
271 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3021  hypothetical protein  29.97 
 
 
271 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2837  hypothetical protein  29.64 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2768  hypothetical protein  33.89 
 
 
290 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.941783 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0041  hypothetical protein  24.63 
 
 
274 aa  85.5  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.4713  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2267  hypothetical protein  28.62 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1631  hypothetical protein  32.19 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000204525  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2857  hypothetical protein  30.94 
 
 
200 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.550879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3646  hypothetical protein  28.25 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.59355  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1083  hypothetical protein  26.76 
 
 
239 aa  49.7  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00230373  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03580  polysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.789751  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1688  hypothetical protein  23.61 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>