74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6260 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6260  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 258 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1819  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 258 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538856  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1843  3'-5' exonuclease  99.22 
 
 		 258 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.0685914 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1757  3'-5' exonuclease  97.67 
 
 		 258 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1730  3'-5' exonuclease  97.67 
 
 		 258 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0609431  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5120  3'-5' exonuclease  96.12 
 
 		 258 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.015476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1454  3'-5' exonuclease  94.57 
 
 		 258 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133375  normal  0.401434 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2235  hypothetical protein  88.37 
 
 		 258 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2364  propable polB  88.37 
 
 		 258 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1843  hypothetical protein  88.37 
 
 		 258 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0054  hypothetical protein  88.37 
 
 		 258 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1115  hypothetical protein  88.37 
 
 		 258 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1353  hypothetical protein  88.37 
 
 		 258 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0220984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2197  hypothetical protein  87.98 
 
 		 258 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2349  putative 3'-5' exonuclease  87.55 
 
 		 258 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.948558  normal  0.0792646 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0963  3'-5' exonuclease  87.55 
 
 		 258 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2227  hypothetical protein  86.82 
 
 		 258 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1838  putative 3'-5' exonuclease  87.16 
 
 		 258 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376243  normal  0.478604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2114  hypothetical protein  69.81 
 
 		 278 aa  391  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0931649  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2094  hypothetical protein  69.06 
 
 		 278 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2217  hypothetical protein  66.4 
 
 		 267 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.392582  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1296  3'-5' exonuclease  63.47 
 
 		 273 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276744  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3027  propable PolB  64.73 
 
 		 262 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1852  hypothetical protein  63.64 
 
 		 258 aa  343  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1288  propable PolB  62.31 
 
 		 261 aa  340  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.671751  normal  0.251577 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0971  hypothetical protein  62.65 
 
 		 267 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1353  hypothetical protein  58.2 
 
 		 263 aa  301  9e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0800  hypothetical protein  56.75 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1101  hypothetical protein  55.04 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0589  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  53.44 
 
 		 268 aa  284  8e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0488742 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1360  hypothetical protein  55.38 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1364  hypothetical protein  55.38 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0029  hypothetical protein  50 
 
 		 257 aa  254  8e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2829  hypothetical protein  52.59 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2451  hypothetical protein  52.16 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0379  hypothetical protein  38.53 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0345  hypothetical protein  39.66 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0744  hypothetical protein  39.76 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.133036  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1248  conserved hypothetical protein, putative polysaccharide biosynthesis protein  34.35 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.813451  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0385  hypothetical protein  36.36 
 
 		 269 aa  166  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000693475  unclonable  0.000000000422197 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0589  polysaccharide biosynthesis protein  35.25 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.92996  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1800  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  35.63 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1274  polysaccharide biosynthesis protein  34.84 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.349568  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1149  polysaccharide biosynthesis protein  34.84 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.803914  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1227  polysaccharide biosynthesis protein  36.48 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.750362  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1398  hypothetical protein  38.1 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.54759  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0477  hypothetical protein  35.85 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0549  hypothetical protein  34.72 
 
 		 275 aa  158  7e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.215773  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0469  large-conductance mechanosensitive channel  34.41 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000368758  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0781  polysaccharide biosynthesis protein  33.92 
 
 		 310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0522762  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0735  hypothetical protein  36.89 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5668  hypothetical protein  38.67 
 
 		 349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2589  hypothetical protein  34.2 
 
 		 325 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5692  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  36.89 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224827  normal  0.358759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2926  hypothetical protein  33.87 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2837  hypothetical protein  33.74 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3021  hypothetical protein  33.87 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7600  hypothetical protein  30 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0041  hypothetical protein  36.09 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.4713  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2267  hypothetical protein  30.59 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2768  hypothetical protein  34.75 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.941783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3646  hypothetical protein  25.93 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.59355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1688  hypothetical protein  28.51 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3714  hypothetical protein  28.12 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1083  hypothetical protein  25.53 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00230373  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03580  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 237 aa  53.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.789751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6525  hypothetical protein  23.21 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1631  hypothetical protein  28.48 
 
 		 229 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000204525  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0137  hypothetical protein  25.22 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  29.37 
 
 		 853 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03067  DNA polymerase epsilon catalytic subunit A (DNA polymerase II subunit A)(EC 2.7.7.7) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O93845]  27.97 
 
 		 2207 aa  45.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.958905 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2857  hypothetical protein  27.27 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.550879  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  25.74 
 
 		 852 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  29.27 
 
 		 854 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>