62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01430 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_03067  DNA polymerase epsilon catalytic subunit A (DNA polymerase II subunit A)(EC 2.7.7.7) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O93845]  47.62 
 
 		 2207 aa  2086    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.958905 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66970  DNA-directed DNA polymerase epsilon, catalytic subunit A  44.73 
 
 		 2222 aa  1947    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.363259 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_150  predicted protein  39.59 
 
 		 2198 aa  1543    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.710895  normal  0.18765 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01430  DNA polymerase epsilon, catalytic subunit a, putative  100 
 
 		 2250 aa  4695    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352674  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_52678  DNA polymerase epsilon catalytic subunit that participates with PCNA in late in S phase DNA replication  38.45 
 
 		 2155 aa  1424    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562682  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  25.17 
 
 		 781 aa  77.4  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  25.17 
 
 		 780 aa  75.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  24.5 
 
 		 780 aa  73.2  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  26.38 
 
 		 810 aa  65.5  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  24.38 
 
 		 811 aa  64.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  25.24 
 
 		 790 aa  62.8  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  23.38 
 
 		 786 aa  60.8  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  21.24 
 
 		 982 aa  60.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  24.15 
 
 		 792 aa  60.5  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  23.05 
 
 		 810 aa  58.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0296  DNA polymerase B region  25.24 
 
 		 743 aa  58.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413746  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  24.26 
 
 		 787 aa  57.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  22.87 
 
 		 810 aa  57.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  22.3 
 
 		 808 aa  56.6  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  22.71 
 
 		 810 aa  56.6  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  23.47 
 
 		 854 aa  55.5  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  24.32 
 
 		 783 aa  55.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  23.28 
 
 		 854 aa  55.1  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  27.52 
 
 		 795 aa  54.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  24.78 
 
 		 821 aa  53.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  22.09 
 
 		 793 aa  53.9  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  24.76 
 
 		 835 aa  53.5  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  23.9 
 
 		 789 aa  53.5  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  22.64 
 
 		 786 aa  52.4  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  24.05 
 
 		 853 aa  52.4  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  23.29 
 
 		 932 aa  52  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  22.63 
 
 		 853 aa  52.4  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  23.49 
 
 		 797 aa  52  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  22.51 
 
 		 781 aa  51.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  22.35 
 
 		 783 aa  51.6  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  21.48 
 
 		 820 aa  51.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  25 
 
 		 789 aa  51.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  23.55 
 
 		 785 aa  51.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  20.75 
 
 		 786 aa  51.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  23.99 
 
 		 787 aa  50.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  25 
 
 		 789 aa  50.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0078  DNA polymerase I-like  25.38 
 
 		 265 aa  50.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  25 
 
 		 789 aa  50.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  22.05 
 
 		 816 aa  50.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  21.43 
 
 		 821 aa  50.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  25.65 
 
 		 786 aa  49.7  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  24.71 
 
 		 1463 aa  49.3  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  22.94 
 
 		 784 aa  49.3  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  25.65 
 
 		 786 aa  49.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  25.91 
 
 		 852 aa  48.9  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  25.43 
 
 		 910 aa  48.9  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  24.35 
 
 		 788 aa  48.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  22.22 
 
 		 794 aa  48.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0006  DNA polymerase B region  25.77 
 
 		 800 aa  48.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0104933 
 
 
-
 
NC_002978  WD0744  hypothetical protein  21.1 
 
 		 273 aa  47.8  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.133036  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0007  DNA polymerase B region  23.55 
 
 		 796 aa  47.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  24.02 
 
 		 788 aa  46.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  21.74 
 
 		 787 aa  46.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  29.46 
 
 		 941 aa  46.6  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  22.18 
 
 		 787 aa  46.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  25.63 
 
 		 990 aa  46.2  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  22.92 
 
 		 795 aa  45.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>