141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_297 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  100 
 
 
990 aa  2047    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  36.69 
 
 
1485 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  35.63 
 
 
1459 aa  516  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  31.63 
 
 
1463 aa  462  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  28.53 
 
 
1058 aa  213  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  27.63 
 
 
1070 aa  210  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  25.26 
 
 
1087 aa  209  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  27.74 
 
 
982 aa  198  4.0000000000000005e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  28.69 
 
 
1044 aa  198  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  26.11 
 
 
932 aa  194  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  26.71 
 
 
910 aa  192  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  25.49 
 
 
941 aa  185  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  27.16 
 
 
783 aa  183  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  26.69 
 
 
785 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  27.39 
 
 
780 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  27.29 
 
 
780 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  27.2 
 
 
781 aa  169  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  27.26 
 
 
786 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  27.58 
 
 
783 aa  168  5e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  27.27 
 
 
794 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  25.24 
 
 
811 aa  164  8.000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  25.48 
 
 
781 aa  162  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  26.85 
 
 
784 aa  159  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  26.09 
 
 
810 aa  152  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  24.34 
 
 
791 aa  145  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  25.49 
 
 
784 aa  139  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  28.38 
 
 
789 aa  139  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  28.38 
 
 
789 aa  139  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  28.38 
 
 
789 aa  138  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  23.74 
 
 
816 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  25.94 
 
 
788 aa  134  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  25.93 
 
 
912 aa  134  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  26.63 
 
 
790 aa  134  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  23.75 
 
 
787 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  24.26 
 
 
793 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  26.33 
 
 
789 aa  132  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  26.11 
 
 
820 aa  132  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  27.97 
 
 
788 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  26.32 
 
 
790 aa  132  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  25.15 
 
 
795 aa  131  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  27.36 
 
 
786 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  24.66 
 
 
794 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  25.08 
 
 
794 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  25.08 
 
 
794 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  24.81 
 
 
792 aa  128  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  25.55 
 
 
788 aa  128  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  24.92 
 
 
791 aa  127  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  25.56 
 
 
783 aa  127  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  25.56 
 
 
783 aa  127  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  24.92 
 
 
788 aa  127  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  24.92 
 
 
787 aa  127  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  25.41 
 
 
783 aa  126  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  24.27 
 
 
795 aa  126  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  25.41 
 
 
783 aa  126  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  25.41 
 
 
783 aa  126  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  25.41 
 
 
783 aa  126  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  25.56 
 
 
783 aa  126  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03700  zeta DNA polymerase, putative  22.87 
 
 
1940 aa  125  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.634072  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  26.07 
 
 
788 aa  125  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  25.6 
 
 
783 aa  125  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  24.01 
 
 
810 aa  125  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  25.41 
 
 
783 aa  125  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  25.85 
 
 
783 aa  124  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  26.04 
 
 
783 aa  124  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249231 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04789  DNA polymerase (EC 2.7.7.7) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X142]  21.6 
 
 
1681 aa  124  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411659  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  24.46 
 
 
818 aa  124  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  24.73 
 
 
790 aa  124  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  25.51 
 
 
788 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  25.11 
 
 
783 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  24.13 
 
 
821 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  25.45 
 
 
783 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42338  DNA polymerase zeta  21.81 
 
 
1489 aa  122  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  25.29 
 
 
787 aa  122  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  25.41 
 
 
787 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  25.86 
 
 
796 aa  121  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  25.49 
 
 
786 aa  121  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  22.95 
 
 
810 aa  121  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  25.12 
 
 
787 aa  121  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  25.65 
 
 
786 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  25.65 
 
 
786 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  26.23 
 
 
794 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  23.37 
 
 
810 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  23.51 
 
 
786 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  28.43 
 
 
853 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  25.86 
 
 
789 aa  117  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  23.41 
 
 
792 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  26.18 
 
 
787 aa  115  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  23.35 
 
 
786 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  24.89 
 
 
799 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  29.08 
 
 
853 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  26.14 
 
 
835 aa  111  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  23.82 
 
 
809 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  23.97 
 
 
809 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  23.62 
 
 
809 aa  111  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  24.42 
 
 
782 aa  110  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  25.33 
 
 
807 aa  110  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  23.11 
 
 
809 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  24.81 
 
 
821 aa  109  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  28.33 
 
 
871 aa  108  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  22.78 
 
 
929 aa  108  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>