85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_150 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_03067  DNA polymerase epsilon catalytic subunit A (DNA polymerase II subunit A)(EC 2.7.7.7) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O93845]  40.66 
 
 		 2207 aa  1585    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.958905 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66970  DNA-directed DNA polymerase epsilon, catalytic subunit A  37.98 
 
 		 2222 aa  1494    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.363259 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_52678  DNA polymerase epsilon catalytic subunit that participates with PCNA in late in S phase DNA replication  38.49 
 
 		 2155 aa  1409    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562682  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_150  predicted protein  100 
 
 		 2198 aa  4583    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.710895  normal  0.18765 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01430  DNA polymerase epsilon, catalytic subunit a, putative  39.62 
 
 		 2250 aa  1549    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352674  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  24.11 
 
 		 781 aa  84  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  24.11 
 
 		 780 aa  82.8  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  24.32 
 
 		 780 aa  79.7  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  23.63 
 
 		 810 aa  77  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  22.72 
 
 		 794 aa  75.1  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  23.48 
 
 		 811 aa  74.7  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  23.39 
 
 		 786 aa  71.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  25.61 
 
 		 783 aa  68.6  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  24.06 
 
 		 982 aa  67.8  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  23.33 
 
 		 785 aa  63.5  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  27.52 
 
 		 795 aa  63.2  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  26.77 
 
 		 789 aa  60.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  22.25 
 
 		 784 aa  59.3  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  25.77 
 
 		 787 aa  58.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  26.76 
 
 		 816 aa  57.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  25.12 
 
 		 787 aa  58.2  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  22.4 
 
 		 783 aa  58.2  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0296  DNA polymerase B region  27.27 
 
 		 743 aa  58.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413746  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  23.09 
 
 		 932 aa  56.6  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  23.83 
 
 		 723 aa  55.5  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  27.78 
 
 		 787 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  21.82 
 
 		 781 aa  54.7  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  21.61 
 
 		 784 aa  54.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  25.79 
 
 		 821 aa  52.8  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  23.77 
 
 		 795 aa  52.8  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  23.56 
 
 		 1044 aa  52.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  25 
 
 		 882 aa  51.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  28.31 
 
 		 818 aa  51.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  23.58 
 
 		 783 aa  50.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  23.4 
 
 		 854 aa  50.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0007  DNA polymerase B region  28.28 
 
 		 796 aa  50.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  23.58 
 
 		 783 aa  50.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  26.15 
 
 		 790 aa  50.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  23.4 
 
 		 792 aa  50.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  26.37 
 
 		 786 aa  50.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  26.15 
 
 		 787 aa  50.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  23.58 
 
 		 783 aa  50.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  23.93 
 
 		 871 aa  50.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  23.87 
 
 		 854 aa  50.1  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  23.67 
 
 		 788 aa  49.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  25.25 
 
 		 786 aa  49.7  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  23.58 
 
 		 818 aa  49.7  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  24.64 
 
 		 788 aa  49.3  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  23.94 
 
 		 810 aa  49.3  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  24.21 
 
 		 789 aa  48.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  23.94 
 
 		 810 aa  48.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  25.64 
 
 		 788 aa  48.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  22.37 
 
 		 783 aa  48.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  25.83 
 
 		 852 aa  49.3  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  24.27 
 
 		 835 aa  48.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  24.04 
 
 		 1485 aa  48.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  24.34 
 
 		 783 aa  47.8  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  24.34 
 
 		 783 aa  47.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  24.34 
 
 		 783 aa  47.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  23.14 
 
 		 783 aa  47.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  25.48 
 
 		 788 aa  47.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  24.34 
 
 		 783 aa  47.8  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  24.34 
 
 		 783 aa  47.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  24.34 
 
 		 783 aa  47.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  23.32 
 
 		 1058 aa  47.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  24.21 
 
 		 789 aa  48.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  24.02 
 
 		 783 aa  47.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2799  DNA polymerase B region  41.54 
 
 		 735 aa  47.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  24.34 
 
 		 783 aa  47.8  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0006  DNA polymerase B region  24.15 
 
 		 800 aa  47.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0104933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  25.25 
 
 		 786 aa  47.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  24.61 
 
 		 789 aa  47.8  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3245  DNA polymerase II, putative  24.24 
 
 		 745 aa  47.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  25.25 
 
 		 786 aa  47.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3187  DNA polymerase B, exonuclease  22.46 
 
 		 744 aa  47  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163636 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  23.16 
 
 		 789 aa  46.6  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  43.4 
 
 		 941 aa  47  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0027  DNA polymerase B region  27.73 
 
 		 796 aa  46.6  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  24.75 
 
 		 786 aa  46.2  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  23.15 
 
 		 794 aa  46.6  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  25.14 
 
 		 788 aa  46.2  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  22.77 
 
 		 809 aa  45.8  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  25.23 
 
 		 1463 aa  46.2  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  24.13 
 
 		 808 aa  46.2  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  21.93 
 
 		 853 aa  45.8  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>