142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86981 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  40.98 
 
 		 1459 aa  1037    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  38.97 
 
 		 1485 aa  766    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  100 
 
 		 1463 aa  3026    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  31.21 
 
 		 990 aa  451  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  24.44 
 
 		 1058 aa  177  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  27.52 
 
 		 783 aa  168  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  31.75 
 
 		 780 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  31.25 
 
 		 780 aa  166  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  26.24 
 
 		 783 aa  165  5.0000000000000005e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  28.1 
 
 		 910 aa  164  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  24.8 
 
 		 794 aa  164  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  24.41 
 
 		 781 aa  162  6e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  32.32 
 
 		 781 aa  159  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  24.07 
 
 		 1087 aa  157  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  27.86 
 
 		 1070 aa  157  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  28.82 
 
 		 932 aa  157  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  27.37 
 
 		 786 aa  156  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  22.1 
 
 		 982 aa  155  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  31.44 
 
 		 1044 aa  154  8.999999999999999e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  27.52 
 
 		 785 aa  154  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  28.12 
 
 		 811 aa  153  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  30.58 
 
 		 810 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  28.13 
 
 		 784 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  23.93 
 
 		 941 aa  149  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  24.35 
 
 		 784 aa  145  6e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  23.15 
 
 		 912 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  28.54 
 
 		 853 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  28.89 
 
 		 853 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  28.81 
 
 		 854 aa  130  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  28.93 
 
 		 854 aa  128  7e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  23.05 
 
 		 929 aa  127  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  24.73 
 
 		 795 aa  127  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  23.61 
 
 		 821 aa  125  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  28.96 
 
 		 852 aa  125  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  25.21 
 
 		 786 aa  124  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  28.35 
 
 		 812 aa  121  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  24.09 
 
 		 795 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  27.84 
 
 		 821 aa  119  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42338  DNA polymerase zeta  22.66 
 
 		 1489 aa  119  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  28 
 
 		 871 aa  116  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  26.03 
 
 		 801 aa  115  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  28.66 
 
 		 1353 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  27.59 
 
 		 882 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  26.49 
 
 		 808 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  23.63 
 
 		 787 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  25.48 
 
 		 789 aa  112  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  26.85 
 
 		 810 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  24.6 
 
 		 791 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  22.55 
 
 		 787 aa  112  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  22.54 
 
 		 796 aa  112  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  28.41 
 
 		 793 aa  112  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  27.05 
 
 		 799 aa  112  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  23.62 
 
 		 787 aa  111  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  24.03 
 
 		 787 aa  110  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  26.42 
 
 		 810 aa  111  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  26.79 
 
 		 818 aa  110  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  26.03 
 
 		 810 aa  110  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  26 
 
 		 807 aa  110  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  25.34 
 
 		 809 aa  109  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  25.88 
 
 		 877 aa  108  7e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  23.78 
 
 		 788 aa  108  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  24.31 
 
 		 792 aa  108  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  25.34 
 
 		 809 aa  107  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  25.11 
 
 		 809 aa  106  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  25.11 
 
 		 809 aa  106  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  23.41 
 
 		 782 aa  105  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04789  DNA polymerase (EC 2.7.7.7) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X142]  23.43 
 
 		 1681 aa  104  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  27.57 
 
 		 818 aa  104  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  26.97 
 
 		 794 aa  104  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  25.26 
 
 		 607 aa  104  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  23.92 
 
 		 791 aa  103  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  24.87 
 
 		 809 aa  103  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  25.67 
 
 		 793 aa  102  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  24.19 
 
 		 816 aa  102  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  24.13 
 
 		 788 aa  102  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  23.62 
 
 		 788 aa  102  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  23.09 
 
 		 786 aa  101  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  24.56 
 
 		 790 aa  101  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  24.51 
 
 		 794 aa  101  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  24.51 
 
 		 794 aa  101  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  25.53 
 
 		 794 aa  101  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  25.23 
 
 		 797 aa  101  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  22.27 
 
 		 789 aa  100  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  22.25 
 
 		 789 aa  100  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  22.27 
 
 		 789 aa  100  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  26.03 
 
 		 790 aa  100  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  23.53 
 
 		 786 aa  100  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  23.43 
 
 		 786 aa  99.8  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  24.24 
 
 		 787 aa  99  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  24.71 
 
 		 788 aa  99.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  25.4 
 
 		 723 aa  98.6  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  23.65 
 
 		 788 aa  98.6  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  26.43 
 
 		 789 aa  98.2  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  25.11 
 
 		 788 aa  98.2  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  27.45 
 
 		 792 aa  97.8  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  22.49 
 
 		 786 aa  97.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  23.32 
 
 		 787 aa  97.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  27.57 
 
 		 816 aa  96.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  27.86 
 
 		 787 aa  95.9  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  22.33 
 
 		 786 aa  95.9  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>