42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0089 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0089  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  269  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2431  transposase IS1380 family protein  46.77 
 
 
494 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  38.64 
 
 
441 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  44.26 
 
 
447 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  44.26 
 
 
447 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  33.96 
 
 
447 aa  63.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 
447 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 
447 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 
447 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 
447 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 
447 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 
447 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 
447 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 
447 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 
447 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 
447 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 
447 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 
447 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 
447 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 
447 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  34.18 
 
 
447 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6188  transposase  46.15 
 
 
255 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0983  transposase, IS4 family protein  30 
 
 
433 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0632  transposase, IS4 family protein  31 
 
 
433 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0435  transposase, IS4 family protein  31 
 
 
433 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0163  transposase, IS4 family protein  31 
 
 
433 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4092  transposase, IS4 family protein  31 
 
 
433 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1632  transposase, IS4  35.14 
 
 
263 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2227  transposase, IS4 family protein  32.95 
 
 
448 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3502  transposase, IS4 family protein  32.95 
 
 
448 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0636  transposase IS4 family protein  31.31 
 
 
435 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0097  transposase, IS4 family protein  36.62 
 
 
325 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0603  transposase IS4 family protein  26.92 
 
 
420 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1258  transposase IS4 family protein  28.38 
 
 
468 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000986472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1453  transposase IS4 family protein  28.38 
 
 
468 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.243782  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1579  transposase IS4 family protein  28.38 
 
 
468 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2110  transposase IS4 family protein  28.38 
 
 
468 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0566508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2153  transposase IS4 family protein  28.38 
 
 
468 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2157  transposase IS4 family protein  28.38 
 
 
468 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2437  transposase IS4 family protein  28.38 
 
 
468 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1019  transposase IS4 family protein  28.38 
 
 
468 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.865831  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0956  transposase IS4 family protein  28.38 
 
 
468 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0821634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>