More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2314 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2314  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  838    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  33.89 
 
 		 434 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 435 aa  239  9e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0193  major facilitator family transporter  34.45 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0168  major facilitator family transporter  35 
 
 		 415 aa  238  2e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  34.02 
 
 		 456 aa  236  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10171  putative proline/betaine transporter, MFS family protein  35.56 
 
 		 420 aa  232  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.643051 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 438 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  31.53 
 
 		 483 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0130  general substrate transporter  32.37 
 
 		 441 aa  229  7e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.471024  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  30.95 
 
 		 489 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  31.19 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  31.06 
 
 		 485 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 443 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  31.06 
 
 		 485 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  31.06 
 
 		 485 aa  227  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  31.06 
 
 		 485 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  31.06 
 
 		 485 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  31.06 
 
 		 485 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  31.06 
 
 		 485 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  31.06 
 
 		 485 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  31.06 
 
 		 485 aa  226  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  31.04 
 
 		 503 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 445 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  32.06 
 
 		 482 aa  225  9e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  29.86 
 
 		 496 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  32.94 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.94 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  32.61 
 
 		 460 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  32.94 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 489 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  32.94 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  32.94 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  32.61 
 
 		 460 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  32.61 
 
 		 460 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  30.95 
 
 		 489 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  30.95 
 
 		 489 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 438 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  33.18 
 
 		 500 aa  223  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  32.08 
 
 		 500 aa  223  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  33.18 
 
 		 500 aa  223  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  31.32 
 
 		 500 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 461 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 443 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  31.32 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  30.71 
 
 		 489 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  30.62 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  34.86 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  29.45 
 
 		 493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  31.09 
 
 		 500 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  33.17 
 
 		 495 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  30.42 
 
 		 503 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  29.1 
 
 		 552 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 444 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0763  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 422 aa  219  7e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000770218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.91 
 
 		 433 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  31.09 
 
 		 500 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 445 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 438 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.96 
 
 		 435 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  31.46 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  31.08 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  32.13 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  33.49 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  31.89 
 
 		 500 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  31.35 
 
 		 433 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0292  hypothetical protein  33.08 
 
 		 431 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  31.22 
 
 		 500 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  31.22 
 
 		 500 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  32.46 
 
 		 441 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  31.22 
 
 		 500 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.77 
 
 		 452 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  29.93 
 
 		 496 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  34.01 
 
 		 445 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1521  major facilitator family transporter  32.11 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.537503  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  30.1 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  32.94 
 
 		 501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  33.17 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0329  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  33.33 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000181979  normal  0.0690464 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6639  general substrate transporter  31.49 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6159  general substrate transporter  31.49 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  31.44 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  31.88 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5794  general substrate transporter  31.49 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390402  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5788  general substrate transporter  31.84 
 
 		 461 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  30.83 
 
 		 430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6031  general substrate transporter  31.84 
 
 		 461 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 495 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 438 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  30.31 
 
 		 436 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  29.45 
 
 		 491 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>