262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0099 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0099  putative exonuclease, truncation  100 
 
 		 173 aa  360  6e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.54613e-37  hitchhiker  7.69558e-79 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  33.14 
 
 		 474 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0774  ribonuclease H  30.86 
 
 		 474 aa  61.6  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  34.87 
 
 		 482 aa  60.8  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  29.61 
 
 		 930 aa  60.8  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  34.07 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  30 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  32.62 
 
 		 956 aa  59.7  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  33.12 
 
 		 956 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1529  5'-3' exonuclease  30.52 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  33.12 
 
 		 988 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  30.5 
 
 		 949 aa  58.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  28.65 
 
 		 899 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  28.65 
 
 		 899 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1500  5'-3' exonuclease  30.52 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  29.73 
 
 		 884 aa  58.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  31.97 
 
 		 946 aa  58.2  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  31.05 
 
 		 878 aa  57  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  28.39 
 
 		 928 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  28.76 
 
 		 934 aa  57  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  29.41 
 
 		 850 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  29.89 
 
 		 480 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  34.44 
 
 		 936 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  33.12 
 
 		 888 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  30.97 
 
 		 905 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  36.75 
 
 		 1022 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  29.68 
 
 		 934 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  34.09 
 
 		 896 aa  55.5  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2058  5'-3' exonuclease  30.32 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.762247  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1012  5'-3' exonuclease, putative  27.22 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667651  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  31.25 
 
 		 904 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0543  DNA polymerase I  26.43 
 
 		 1024 aa  54.7  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72991  normal  0.283494 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  27.59 
 
 		 879 aa  54.3  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  33.56 
 
 		 866 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  30.52 
 
 		 893 aa  53.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  33.11 
 
 		 965 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  32.47 
 
 		 917 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  30.07 
 
 		 944 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  32.47 
 
 		 917 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  28.74 
 
 		 877 aa  53.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  32.47 
 
 		 917 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  32.08 
 
 		 901 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  28.99 
 
 		 908 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1316  5'-3' exonuclease  30.65 
 
 		 288 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000236171  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 937 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 937 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  27.66 
 
 		 932 aa  52  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  35.48 
 
 		 890 aa  52  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  33.96 
 
 		 943 aa  51.6  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  30.07 
 
 		 910 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0459  Exo  29.95 
 
 		 289 aa  51.6  0.000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.454696  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  31.82 
 
 		 917 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1059  DNA polymerase I  35.09 
 
 		 921 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000233773  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2803  DNA polymerase I  28.17 
 
 		 994 aa  51.2  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  32.68 
 
 		 941 aa  51.2  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  31.82 
 
 		 917 aa  51.2  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  32.24 
 
 		 917 aa  51.2  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  31.82 
 
 		 917 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  32.03 
 
 		 972 aa  50.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  28.48 
 
 		 939 aa  50.8  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  30.38 
 
 		 915 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  26.86 
 
 		 877 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  26.86 
 
 		 877 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1489  5'-3' exonuclease family protein  33.96 
 
 		 288 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  26.86 
 
 		 891 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1462  5'-3' exonuclease  33.96 
 
 		 288 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  26.86 
 
 		 891 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl055  5'-3' exonuclease  31.58 
 
 		 317 aa  50.1  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1461  5'-3' exonuclease  33.96 
 
 		 288 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  32.89 
 
 		 906 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1754  5'-3' exonuclease family protein  33.96 
 
 		 288 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0435319  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  27.1 
 
 		 917 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  33.04 
 
 		 891 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1675  5'-3' exonuclease family protein  33.96 
 
 		 288 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1606  5'-3' exonuclease family protein  33.96 
 
 		 288 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  26.86 
 
 		 877 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  31.58 
 
 		 926 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  34.59 
 
 		 942 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  26.86 
 
 		 877 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 934 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  33.55 
 
 		 939 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  26.86 
 
 		 877 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  26.86 
 
 		 877 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0780  DNA polymerase I  29.03 
 
 		 866 aa  49.7  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  29.87 
 
 		 932 aa  49.7  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1707  5'-3' exonuclease  33.96 
 
 		 288 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00574418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  33.67 
 
 		 936 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  25.58 
 
 		 880 aa  50.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  28 
 
 		 891 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  27.27 
 
 		 896 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  26.62 
 
 		 896 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  30.92 
 
 		 905 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  26.29 
 
 		 877 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  27.95 
 
 		 920 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3702  5'-3' exonuclease family protein  29.84 
 
 		 288 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00175288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  29.03 
 
 		 893 aa  49.7  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  29.87 
 
 		 932 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  27.95 
 
 		 920 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  29.87 
 
 		 932 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  29.19 
 
 		 323 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>