More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1101 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  100 
 
 		 267 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  99.63 
 
 		 267 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  77.9 
 
 		 267 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  75.66 
 
 		 267 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  75.66 
 
 		 267 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  75.28 
 
 		 267 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  75.66 
 
 		 267 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  75.28 
 
 		 267 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  75.28 
 
 		 267 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.91 
 
 		 267 aa  401  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.91 
 
 		 267 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.53 
 
 		 267 aa  401  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  73.41 
 
 		 267 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  73.41 
 
 		 274 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.16 
 
 		 274 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  73.41 
 
 		 267 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  73.03 
 
 		 274 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  73.78 
 
 		 274 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  69.29 
 
 		 267 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.91 
 
 		 267 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.79 
 
 		 267 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.79 
 
 		 267 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.16 
 
 		 267 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 268 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.42 
 
 		 268 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 268 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.79 
 
 		 267 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.04 
 
 		 268 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 268 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 268 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 268 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.54 
 
 		 268 aa  361  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.04 
 
 		 268 aa  360  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.79 
 
 		 272 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.54 
 
 		 268 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.28 
 
 		 272 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.04 
 
 		 268 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  63.67 
 
 		 267 aa  342  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  63.02 
 
 		 273 aa  342  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  61.05 
 
 		 283 aa  340  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  60.75 
 
 		 277 aa  338  7e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  63.4 
 
 		 267 aa  332  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  60.97 
 
 		 269 aa  325  6e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  60.49 
 
 		 246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  52.08 
 
 		 271 aa  282  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.81 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  50 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  50.75 
 
 		 280 aa  267  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  46.42 
 
 		 273 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  45.72 
 
 		 278 aa  249  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  44.4 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  43.45 
 
 		 274 aa  221  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  43.28 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  43.66 
 
 		 275 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  43.82 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  40.67 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  40.3 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  40.38 
 
 		 272 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  40.52 
 
 		 274 aa  204  9e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  41.42 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  41.51 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  39.62 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  42.32 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  39.1 
 
 		 276 aa  198  9e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  36.98 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  42.36 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  40.93 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  38.43 
 
 		 274 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  38.43 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  37.74 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  41.15 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  40.7 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  40.54 
 
 		 274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  41.92 
 
 		 276 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  41.64 
 
 		 268 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.06 
 
 		 274 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  39.38 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  40.7 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  40.86 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  41.35 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  36.98 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  38.75 
 
 		 282 aa  185  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38150  Aldo/keto reductase  38.06 
 
 		 277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  38.43 
 
 		 277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.55 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0988  2,5-didehydrogluconate reductase  38.76 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  37.93 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  36.12 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0672  aldo/keto reductase  36.15 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2314  oxidoreductase, chromogranin/secretogranin  38.37 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  36.78 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  37.85 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4977  2,5-didehydrogluconate reductase  37.07 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  35.74 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  40.08 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.6 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2214  aldo/keto reductase  36.98 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3766  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  37.83 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  37.21 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4205  2,5-didehydrogluconate reductase  40.54 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>