More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_09980 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  100 
 
 
272 aa  547  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  91.18 
 
 
272 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  84.15 
 
 
267 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  83.02 
 
 
267 aa  457  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  81.13 
 
 
267 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  80.38 
 
 
267 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  81.13 
 
 
267 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  79.62 
 
 
267 aa  434  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.72 
 
 
268 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  73.51 
 
 
268 aa  407  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.72 
 
 
268 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.72 
 
 
268 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.34 
 
 
268 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.72 
 
 
268 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.34 
 
 
268 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.34 
 
 
268 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  72.39 
 
 
268 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  72.01 
 
 
268 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  72.45 
 
 
268 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.3 
 
 
267 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 
274 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.17 
 
 
274 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.42 
 
 
274 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.17 
 
 
267 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.66 
 
 
267 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.04 
 
 
267 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.28 
 
 
267 aa  362  4e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.28 
 
 
267 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  65.28 
 
 
267 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  65.66 
 
 
267 aa  361  8e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.28 
 
 
267 aa  360  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.66 
 
 
283 aa  360  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.91 
 
 
267 aa  360  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.28 
 
 
267 aa  360  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  66.04 
 
 
267 aa  359  2e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.28 
 
 
267 aa  359  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.28 
 
 
267 aa  359  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 
274 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.53 
 
 
267 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  64.44 
 
 
277 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  64.42 
 
 
269 aa  343  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  64.91 
 
 
273 aa  336  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  61.79 
 
 
246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  60.75 
 
 
267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  52.45 
 
 
271 aa  271  7e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  47.21 
 
 
278 aa  262  4e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  48.3 
 
 
268 aa  259  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  49.06 
 
 
280 aa  258  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.55 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  45.83 
 
 
273 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  46.72 
 
 
275 aa  238  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  47.19 
 
 
274 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  48.12 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  48.12 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  45.11 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  42.64 
 
 
276 aa  215  7e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  42.26 
 
 
272 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
274 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  43.61 
 
 
274 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  44.19 
 
 
274 aa  205  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  40.66 
 
 
282 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  44.74 
 
 
274 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  42.64 
 
 
277 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  40.6 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  45.86 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.86 
 
 
273 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  41.35 
 
 
274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  41.33 
 
 
272 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  45.6 
 
 
277 aa  198  7.999999999999999e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  40.6 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  43.02 
 
 
282 aa  192  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  43.8 
 
 
277 aa  192  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  41.25 
 
 
274 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  39.85 
 
 
272 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  41.35 
 
 
274 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  41.35 
 
 
274 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0743  2,5-didehydrogluconate reductase  36.6 
 
 
279 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0727  2,5-didehydrogluconate reductase  36.6 
 
 
279 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.98 
 
 
274 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  43.2 
 
 
276 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0196  2,5-didehydrogluconate reductase  39.69 
 
 
277 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  38.58 
 
 
280 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  43.7 
 
 
270 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  44.27 
 
 
279 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  42.91 
 
 
268 aa  185  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0181  2,5-didehydrogluconate reductase  38.55 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5283  aldo/keto reductase  41.94 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0154862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38150  Aldo/keto reductase  42.11 
 
 
277 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2314  oxidoreductase, chromogranin/secretogranin  42.69 
 
 
272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  38.58 
 
 
275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  41.57 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0600  2,5-didehydrogluconate reductase  38.61 
 
 
267 aa  182  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  39.85 
 
 
277 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0988  2,5-didehydrogluconate reductase  42.29 
 
 
272 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0672  aldo/keto reductase  38.61 
 
 
280 aa  182  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  38.04 
 
 
274 aa  181  9.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  36.54 
 
 
276 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  38.74 
 
 
279 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  39.53 
 
 
278 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
276 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>