More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1306 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  100 
 
 
274 aa  558  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  59.85 
 
 
274 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  60.58 
 
 
274 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  58.36 
 
 
274 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  62.08 
 
 
273 aa  330  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  56.34 
 
 
274 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  56.34 
 
 
274 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  55.97 
 
 
274 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  53.53 
 
 
277 aa  308  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  55.22 
 
 
274 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38150  Aldo/keto reductase  53.9 
 
 
277 aa  301  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  48.89 
 
 
274 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.93 
 
 
274 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  44.07 
 
 
272 aa  244  9e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.3 
 
 
274 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.64 
 
 
267 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.93 
 
 
274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.13 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.27 
 
 
267 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.27 
 
 
267 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  46.27 
 
 
267 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.52 
 
 
267 aa  242  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  45.9 
 
 
267 aa  241  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.9 
 
 
267 aa  241  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.39 
 
 
283 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.27 
 
 
267 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.52 
 
 
267 aa  239  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.39 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.27 
 
 
267 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  44.87 
 
 
272 aa  238  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.52 
 
 
267 aa  238  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.27 
 
 
267 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  44.53 
 
 
271 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.3 
 
 
274 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.78 
 
 
267 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.86 
 
 
268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  48.5 
 
 
277 aa  235  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  47.73 
 
 
273 aa  234  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  43.54 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  44.32 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.12 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.4 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  47.92 
 
 
267 aa  231  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.49 
 
 
268 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  43.01 
 
 
276 aa  231  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.28 
 
 
267 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.27 
 
 
267 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  42.97 
 
 
272 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  46.34 
 
 
277 aa  227  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.36 
 
 
268 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.36 
 
 
268 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.36 
 
 
268 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.4 
 
 
267 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.52 
 
 
267 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.61 
 
 
268 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.98 
 
 
268 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.44 
 
 
272 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  42.59 
 
 
272 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  43.94 
 
 
277 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0672  aldo/keto reductase  44.11 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.75 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.61 
 
 
268 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.23 
 
 
268 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  43.32 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  44.27 
 
 
268 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  44.07 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.19 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  42.21 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  40.96 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  44.03 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  42.16 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.57 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  40.91 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  41.89 
 
 
268 aa  209  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
282 aa  209  5e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0556  aldo/keto reductase  46.25 
 
 
277 aa  208  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2214  aldo/keto reductase  41.92 
 
 
268 aa  207  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0311  aldo/keto reductase  41.6 
 
 
267 aa  205  8e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.26 
 
 
246 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  43.92 
 
 
270 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  38.71 
 
 
278 aa  199  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5283  aldo/keto reductase  40.62 
 
 
282 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0154862 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0336  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  40.78 
 
 
275 aa  198  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1990  aldo/keto reductase  42.35 
 
 
286 aa  198  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  38.52 
 
 
276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0343  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  41.18 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  42.51 
 
 
274 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3408  aldo/keto reductase  41.6 
 
 
267 aa  196  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.174673  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2848  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
267 aa  195  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  41.86 
 
 
281 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  38.38 
 
 
274 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  41.09 
 
 
274 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3766  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  39.78 
 
 
281 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  38.28 
 
 
274 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  38.58 
 
 
281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  38.28 
 
 
275 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  40.08 
 
 
274 aa  188  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.68 
 
 
275 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  37.69 
 
 
282 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  39.84 
 
 
275 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>