More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5364 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  100 
 
 		 267 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  86.89 
 
 		 267 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  89.14 
 
 		 267 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  85.02 
 
 		 267 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  84.27 
 
 		 267 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  83.02 
 
 		 272 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  83.83 
 
 		 272 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  83.15 
 
 		 267 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  77.74 
 
 		 268 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  75.94 
 
 		 268 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  77.36 
 
 		 268 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  76.32 
 
 		 268 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  76.6 
 
 		 268 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  76.23 
 
 		 268 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  76.6 
 
 		 268 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  76.6 
 
 		 268 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  75.47 
 
 		 268 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.72 
 
 		 268 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.72 
 
 		 268 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  71.91 
 
 		 267 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  69.29 
 
 		 267 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  69.29 
 
 		 267 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.54 
 
 		 274 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.16 
 
 		 274 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.16 
 
 		 274 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.16 
 
 		 267 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.79 
 
 		 267 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.42 
 
 		 267 aa  371  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.79 
 
 		 267 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  67.42 
 
 		 267 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.42 
 
 		 267 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.79 
 
 		 267 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  67.79 
 
 		 267 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.42 
 
 		 267 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.04 
 
 		 267 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  66.67 
 
 		 267 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.29 
 
 		 267 aa  364  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.16 
 
 		 274 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.42 
 
 		 283 aa  357  9e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  63.77 
 
 		 277 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  64.81 
 
 		 269 aa  341  9e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  64.53 
 
 		 273 aa  338  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.41 
 
 		 246 aa  311  7.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  61.89 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  51.7 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  49.44 
 
 		 278 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  49.62 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  49.81 
 
 		 271 aa  256  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  47.55 
 
 		 273 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  48.12 
 
 		 280 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  48.69 
 
 		 274 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  45.15 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  45.52 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  46.07 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  44.03 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  43.66 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  42.26 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  44.24 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  44.24 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  43.77 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  43.66 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  43.01 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  44.22 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  41.33 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  39.85 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  40.38 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  40.59 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  40 
 
 		 272 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.03 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  43.68 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 274 aa  195  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  39.08 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  43.02 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  42.54 
 
 		 274 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  43.36 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  43.24 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  43.53 
 
 		 270 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  43.65 
 
 		 276 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0181  2,5-didehydrogluconate reductase  39.46 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  40.67 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5104  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.46 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  39.61 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0222  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.46 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  43.19 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0216  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.08 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4086  aldo/keto reductase  40.54 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.968066 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0197  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.08 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0216  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.08 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0196  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.08 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0239  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.08 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  42.16 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3761  2,5-didehydrogluconate reductase  39.46 
 
 		 276 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0184  aldo/keto reductase  38.7 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  43.08 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  44.49 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  40.78 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0187  aldo/keto reductase  39.08 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  40.67 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0743  2,5-didehydrogluconate reductase  36.86 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  43.75 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>