More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0288 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  100 
 
 		 274 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  54.21 
 
 		 272 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  54.74 
 
 		 274 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  51.28 
 
 		 272 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  51.28 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  54.04 
 
 		 277 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  50.92 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  48.91 
 
 		 275 aa  285  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  48.72 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  49.81 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  48.89 
 
 		 274 aa  267  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  49.22 
 
 		 277 aa  258  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  48.5 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  44.89 
 
 		 274 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  48.35 
 
 		 279 aa  247  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  44.32 
 
 		 274 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  45.62 
 
 		 274 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  45.26 
 
 		 274 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  44.16 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  48.31 
 
 		 277 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  43.75 
 
 		 277 aa  238  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  46.38 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  45.62 
 
 		 274 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.89 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38150  Aldo/keto reductase  45.19 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  43.8 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  41.73 
 
 		 273 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  46.39 
 
 		 276 aa  231  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.19 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.57 
 
 		 268 aa  228  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  45.26 
 
 		 274 aa  228  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  45.42 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.58 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0556  aldo/keto reductase  47.04 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.63 
 
 		 275 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.98 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  44.22 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.15 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  44.32 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.07 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.36 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  46.62 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  40.71 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.25 
 
 		 357 aa  219  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.49 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.94 
 
 		 268 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.8 
 
 		 274 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.24 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.87 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.49 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.32 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.12 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.32 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.32 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  42.7 
 
 		 280 aa  216  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.75 
 
 		 267 aa  214  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.57 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.38 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2028  2,5-didehydrogluconate reductase  44.4 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  41.95 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.94 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1990  aldo/keto reductase  44.22 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.38 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  42.38 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.38 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.87 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  46.33 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  40.84 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.38 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.24 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.07 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  42.38 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  41.57 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.07 
 
 		 274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.24 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  44.65 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.01 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  44.83 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.94 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2041  aldo/keto reductase  41.73 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1850  2,5-didehydrogluconate reductase  45 
 
 		 277 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.671813  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0672  aldo/keto reductase  41.76 
 
 		 280 aa  208  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.38 
 
 		 267 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.31 
 
 		 275 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  43.31 
 
 		 275 aa  208  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.31 
 
 		 275 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.31 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  45.63 
 
 		 276 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  43.7 
 
 		 275 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  43.41 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1935  2,5-didehydrogluconate reductase  45 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.91 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  41.64 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2300  2,5-didehydrogluconate reductase  43.41 
 
 		 278 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  40.54 
 
 		 276 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  43.82 
 
 		 270 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.19 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2214  aldo/keto reductase  42.75 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.93 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3984  aldo/keto reductase  40.78 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>