More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1154 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  100 
 
 		 283 aa  568  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.67 
 
 		 267 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  70.57 
 
 		 277 aa  371  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.92 
 
 		 268 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.29 
 
 		 267 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.31 
 
 		 274 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.67 
 
 		 267 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.04 
 
 		 268 aa  363  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.67 
 
 		 272 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.54 
 
 		 267 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.15 
 
 		 267 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.79 
 
 		 267 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.17 
 
 		 267 aa  360  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.66 
 
 		 272 aa  360  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.77 
 
 		 267 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  63.77 
 
 		 267 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.57 
 
 		 274 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.2 
 
 		 274 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.79 
 
 		 268 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.77 
 
 		 267 aa  358  5e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  63.77 
 
 		 267 aa  358  7e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.4 
 
 		 267 aa  358  8e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.04 
 
 		 268 aa  357  8e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.02 
 
 		 267 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.4 
 
 		 267 aa  357  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.42 
 
 		 267 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.66 
 
 		 268 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.66 
 
 		 268 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.66 
 
 		 268 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.02 
 
 		 267 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.66 
 
 		 268 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.04 
 
 		 268 aa  354  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.04 
 
 		 268 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.39 
 
 		 267 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.53 
 
 		 268 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.57 
 
 		 274 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  62.92 
 
 		 267 aa  348  7e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  65.06 
 
 		 269 aa  347  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  66.79 
 
 		 273 aa  344  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  61.05 
 
 		 267 aa  340  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  61.05 
 
 		 267 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  65.28 
 
 		 267 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.82 
 
 		 246 aa  322  5e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  57.68 
 
 		 267 aa  319  3e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  57.14 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  50.94 
 
 		 267 aa  285  7e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  53.38 
 
 		 268 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  50.19 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  49.81 
 
 		 278 aa  269  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  51.32 
 
 		 280 aa  268  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  45.71 
 
 		 275 aa  245  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  49.06 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  47.39 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  45.86 
 
 		 272 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  45.36 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  44.36 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  46.24 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  44.03 
 
 		 274 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  43.66 
 
 		 274 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  43.88 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  43.45 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  45.15 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  44.91 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  46.25 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  46.67 
 
 		 274 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  44.7 
 
 		 270 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  45.35 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  41.89 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  45.35 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.62 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  44.4 
 
 		 276 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  38.27 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  43.66 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  44.57 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  41.95 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  41.89 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  42.25 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  40.43 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  45.15 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  40.38 
 
 		 272 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  44.94 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3984  aldo/keto reductase  42.16 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  38.78 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  45.76 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  45.56 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  45.45 
 
 		 279 aa  199  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.55 
 
 		 274 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  40.23 
 
 		 276 aa  198  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  40.65 
 
 		 272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2522  2,5-didehydrogluconate reductase  36.47 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0538132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  45.11 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  39.92 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  37.59 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5283  aldo/keto reductase  41.91 
 
 		 282 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0154862 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  41.35 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  41.48 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0181  2,5-didehydrogluconate reductase  36.84 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  37.13 
 
 		 275 aa  192  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0197  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.98 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0216  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.98 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>