More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0968 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  100 
 
 
274 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  83.58 
 
 
274 aa  454  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  67.41 
 
 
278 aa  377  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2023  2,5-didehydrogluconate reductase  64.81 
 
 
278 aa  364  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2300  2,5-didehydrogluconate reductase  65.19 
 
 
278 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  67.04 
 
 
276 aa  362  3e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  64 
 
 
276 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  60.81 
 
 
276 aa  357  8e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4977  2,5-didehydrogluconate reductase  62.77 
 
 
294 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.61 
 
 
275 aa  353  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  64.1 
 
 
274 aa  351  5.9999999999999994e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  63.33 
 
 
276 aa  348  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  63.43 
 
 
270 aa  347  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.24 
 
 
357 aa  346  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  62.59 
 
 
272 aa  342  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1500  putative oxidoreductase protein  61.4 
 
 
276 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181777  normal  0.869656 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0988  2,5-didehydrogluconate reductase  58.97 
 
 
272 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  58.15 
 
 
276 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2314  oxidoreductase, chromogranin/secretogranin  58.24 
 
 
272 aa  329  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3761  2,5-didehydrogluconate reductase  59.26 
 
 
276 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  60.74 
 
 
281 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  58.24 
 
 
272 aa  325  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0685  2,5-didehydrogluconate reductase  57.88 
 
 
281 aa  322  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689254  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4086  aldo/keto reductase  57.78 
 
 
276 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.968066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  56.99 
 
 
276 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  57.99 
 
 
276 aa  319  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  56.04 
 
 
276 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163279  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0835  aldo/keto reductase  58.24 
 
 
281 aa  315  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.600409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1919  2,5-didehydrogluconate reductase  55.84 
 
 
276 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4216  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  54.95 
 
 
274 aa  312  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296306  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1989  aldo/keto reductase  56.1 
 
 
291 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000065841 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0586  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  54.18 
 
 
275 aa  309  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  54.38 
 
 
278 aa  308  8e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0667  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  53.45 
 
 
277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0272  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  53.82 
 
 
277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  57.35 
 
 
280 aa  303  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3766  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  53.68 
 
 
281 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02885  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  54.51 
 
 
275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0687  2,5-didehydrogluconate reductase  54.51 
 
 
275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02835  hypothetical protein  54.51 
 
 
275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3480  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  54.51 
 
 
275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0336  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  52.75 
 
 
275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0684  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  54.51 
 
 
275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3190  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  54.51 
 
 
275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4323  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  54.15 
 
 
275 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3297  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  54.15 
 
 
275 aa  300  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.292953 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3440  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  54.15 
 
 
275 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4349  2,5-didehydrogluconate reductase  57.72 
 
 
275 aa  299  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  56.18 
 
 
277 aa  298  7e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0343  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  51.65 
 
 
275 aa  298  7e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  56.51 
 
 
282 aa  297  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4205  2,5-didehydrogluconate reductase  55.19 
 
 
279 aa  296  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  56.3 
 
 
279 aa  295  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3423  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  53.28 
 
 
275 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  53.48 
 
 
282 aa  292  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00820  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  52.73 
 
 
276 aa  292  5e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  54.21 
 
 
281 aa  291  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02540  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  54.65 
 
 
279 aa  291  9e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3604  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  54.07 
 
 
281 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  55.35 
 
 
279 aa  289  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  51.27 
 
 
275 aa  289  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  52.75 
 
 
275 aa  285  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  52.19 
 
 
275 aa  285  8e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  52.01 
 
 
282 aa  284  9e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  52.01 
 
 
282 aa  284  9e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03850  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  51.84 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1938  2,5-didehydrogluconate reductase  53.33 
 
 
283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1984  2,5-didehydrogluconate reductase  53.33 
 
 
283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062143  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  50.92 
 
 
282 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1913  2,5-didehydrogluconate reductase  52.21 
 
 
278 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.143661  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1918  2,5-didehydrogluconate reductase  52.96 
 
 
283 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2581  2,5-didehydrogluconate reductase  53.26 
 
 
282 aa  280  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.55 
 
 
275 aa  279  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.37 
 
 
312 aa  279  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3420  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  53.79 
 
 
275 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.355756  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3349  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  53.79 
 
 
275 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3414  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  53.79 
 
 
275 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3515  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  53.79 
 
 
275 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.944641  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3340  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  53.43 
 
 
275 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  50.91 
 
 
275 aa  277  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4383  aldo/keto reductase  52.03 
 
 
283 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.18 
 
 
275 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.18 
 
 
275 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  50.18 
 
 
275 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1002  aldo/keto diketogulonate reductase  52.54 
 
 
289 aa  276  3e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.18 
 
 
275 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  50.18 
 
 
275 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2582  aldo/keto reductase  48.16 
 
 
276 aa  275  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0247931  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  50.18 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  49.09 
 
 
275 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2252  2,5-didehydrogluconate reductase  51.14 
 
 
291 aa  270  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202758  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0362  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.32 
 
 
279 aa  270  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1600  2,5-didehydrogluconate reductase  49.64 
 
 
289 aa  268  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2688  aldo/keto reductase  51.09 
 
 
278 aa  268  8e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0264526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1172  2,5-didehydrogluconate reductase  50.73 
 
 
281 aa  267  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.586801  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0491  aldo/keto reductase  53.96 
 
 
273 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.333273 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0181  2,5-didehydrogluconate reductase  49.07 
 
 
277 aa  265  8e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4126  2,5-didehydrogluconate reductase  50.18 
 
 
294 aa  265  8e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12986  oxidoreductase  50.37 
 
 
282 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  51.28 
 
 
274 aa  264  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>