More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2314 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2314  oxidoreductase, chromogranin/secretogranin  100 
 
 		 272 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0988  2,5-didehydrogluconate reductase  98.16 
 
 		 272 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  87.87 
 
 		 272 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2582  aldo/keto reductase  59.33 
 
 		 276 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0247931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  58.24 
 
 		 274 aa  329  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  59.18 
 
 		 270 aa  328  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  59.7 
 
 		 278 aa  322  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2300  2,5-didehydrogluconate reductase  58.58 
 
 		 278 aa  316  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109418 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  53.9 
 
 		 276 aa  314  8e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2023  2,5-didehydrogluconate reductase  58.21 
 
 		 278 aa  314  8e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.16 
 
 		 275 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  56.3 
 
 		 274 aa  308  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.16 
 
 		 357 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  55.97 
 
 		 276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  52.42 
 
 		 276 aa  305  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4977  2,5-didehydrogluconate reductase  55.02 
 
 		 294 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  52.79 
 
 		 276 aa  301  9e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1500  putative oxidoreductase protein  57.74 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181777  normal  0.869656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  54.28 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  53.93 
 
 		 281 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3761  2,5-didehydrogluconate reductase  52.06 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4086  aldo/keto reductase  52.4 
 
 		 276 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.968066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  52.43 
 
 		 272 aa  288  9e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4216  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  49.81 
 
 		 274 aa  285  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0685  2,5-didehydrogluconate reductase  51.3 
 
 		 281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  49.63 
 
 		 276 aa  281  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  52.06 
 
 		 274 aa  281  9e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  50 
 
 		 276 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1919  2,5-didehydrogluconate reductase  50 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0667  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  48.18 
 
 		 277 aa  278  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0586  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  48.18 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0272  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  47.81 
 
 		 277 aa  276  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0835  aldo/keto reductase  51.28 
 
 		 281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.600409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  50.37 
 
 		 279 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03850  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  51.48 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1913  2,5-didehydrogluconate reductase  49.07 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.143661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  46.84 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  50.56 
 
 		 277 aa  269  5e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0684  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.13 
 
 		 275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02885  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.13 
 
 		 275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0687  2,5-didehydrogluconate reductase  46.13 
 
 		 275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00820  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  48.71 
 
 		 276 aa  268  5.9999999999999995e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3480  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.13 
 
 		 275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02835  hypothetical protein  46.13 
 
 		 275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3190  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.13 
 
 		 275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4323  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.13 
 
 		 275 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3297  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  45.76 
 
 		 275 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.292953 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1989  aldo/keto reductase  47.7 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000065841 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3423  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.13 
 
 		 275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3440  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  45.76 
 
 		 275 aa  266  4e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0336  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  47.37 
 
 		 275 aa  265  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  51.12 
 
 		 282 aa  265  5.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  45.56 
 
 		 275 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3766  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.3 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  48.18 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  48.34 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0343  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.62 
 
 		 275 aa  262  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  47.78 
 
 		 276 aa  261  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  45.86 
 
 		 275 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1540  aldo/keto reductase  49.45 
 
 		 287 aa  258  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.199224 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  45.32 
 
 		 275 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  46.69 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0600  2,5-didehydrogluconate reductase  42.91 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  46.69 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3340  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  47.04 
 
 		 275 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2028  2,5-didehydrogluconate reductase  49.81 
 
 		 277 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1172  2,5-didehydrogluconate reductase  49.08 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.586801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3515  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.67 
 
 		 275 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.944641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3414  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.67 
 
 		 275 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3349  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.67 
 
 		 275 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3420  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.67 
 
 		 275 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.355756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4383  aldo/keto reductase  47.96 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  47.01 
 
 		 279 aa  255  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2768  2,5-didehydrogluconate reductase  50.19 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  45.96 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.44 
 
 		 275 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  44.44 
 
 		 275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.07 
 
 		 312 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.07 
 
 		 275 aa  251  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.07 
 
 		 275 aa  251  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  44.07 
 
 		 275 aa  251  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.07 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  44.44 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  45.11 
 
 		 274 aa  250  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  44.44 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  44.44 
 
 		 275 aa  250  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4349  2,5-didehydrogluconate reductase  49.63 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3900  aldo/keto reductase  46.32 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.835176  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1972  2,5-didehydrogluconate reductase  45.65 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4205  2,5-didehydrogluconate reductase  44.4 
 
 		 279 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02540  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  46.62 
 
 		 279 aa  245  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3604  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  47.19 
 
 		 281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0181  2,5-didehydrogluconate reductase  43.28 
 
 		 277 aa  245  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  44.98 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0196  2,5-didehydrogluconate reductase  42.11 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1938  2,5-didehydrogluconate reductase  44.4 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1984  2,5-didehydrogluconate reductase  44.4 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0239  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.95 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0216  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.95 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1600  2,5-didehydrogluconate reductase  46.35 
 
 		 289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>