More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2300 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2300  2,5-didehydrogluconate reductase  100 
 
 
278 aa  565  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2023  2,5-didehydrogluconate reductase  99.64 
 
 
278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  89.57 
 
 
278 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4977  2,5-didehydrogluconate reductase  64.94 
 
 
294 aa  371  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  65.19 
 
 
274 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  62.59 
 
 
276 aa  351  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  64.07 
 
 
274 aa  348  7e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  57.56 
 
 
275 aa  345  6e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  57.2 
 
 
276 aa  343  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  57.2 
 
 
357 aa  338  5e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1500  putative oxidoreductase protein  62.36 
 
 
276 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181777  normal  0.869656 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  56.93 
 
 
276 aa  332  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  60.22 
 
 
272 aa  332  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3761  2,5-didehydrogluconate reductase  56.13 
 
 
276 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  61.34 
 
 
270 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  58.52 
 
 
276 aa  320  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  59.7 
 
 
272 aa  319  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4086  aldo/keto reductase  55.76 
 
 
276 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.968066 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2314  oxidoreductase, chromogranin/secretogranin  58.58 
 
 
272 aa  316  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0988  2,5-didehydrogluconate reductase  58.96 
 
 
272 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  57.88 
 
 
276 aa  311  5.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  56.46 
 
 
281 aa  308  6.999999999999999e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  58.46 
 
 
276 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  55.88 
 
 
274 aa  305  6e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  54.74 
 
 
282 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  54.74 
 
 
282 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1919  2,5-didehydrogluconate reductase  52.4 
 
 
276 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1989  aldo/keto reductase  53.17 
 
 
291 aa  298  9e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000065841 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  52.21 
 
 
276 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163279  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00820  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  52.42 
 
 
276 aa  296  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  53.65 
 
 
282 aa  294  9e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  54.98 
 
 
276 aa  293  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  51.8 
 
 
277 aa  290  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3766  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  51.67 
 
 
281 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  53.43 
 
 
282 aa  285  5e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0685  2,5-didehydrogluconate reductase  50.55 
 
 
281 aa  285  8e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689254  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  51.47 
 
 
278 aa  281  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1913  2,5-didehydrogluconate reductase  52.79 
 
 
278 aa  281  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.143661  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0586  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  51.47 
 
 
275 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0684  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  51.11 
 
 
275 aa  280  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02885  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  51.11 
 
 
275 aa  280  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0687  2,5-didehydrogluconate reductase  51.11 
 
 
275 aa  280  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3480  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  51.11 
 
 
275 aa  280  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3297  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  51.11 
 
 
275 aa  280  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.292953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  51.09 
 
 
282 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02835  hypothetical protein  51.11 
 
 
275 aa  280  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3190  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  51.11 
 
 
275 aa  280  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  52.38 
 
 
281 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0272  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  51.1 
 
 
277 aa  280  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4216  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  50.72 
 
 
274 aa  279  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296306  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4323  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  50.74 
 
 
275 aa  279  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0667  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  50.74 
 
 
277 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3440  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  50.74 
 
 
275 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0835  aldo/keto reductase  51.29 
 
 
281 aa  276  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.600409 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15550  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  52.55 
 
 
282 aa  276  3e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00501077  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3604  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  51.81 
 
 
281 aa  275  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  51.65 
 
 
279 aa  271  9e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  49.82 
 
 
279 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1172  2,5-didehydrogluconate reductase  53.64 
 
 
281 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.586801  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0336  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  49.44 
 
 
275 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4349  2,5-didehydrogluconate reductase  53.73 
 
 
275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  48.89 
 
 
275 aa  268  7e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1600  2,5-didehydrogluconate reductase  50.73 
 
 
289 aa  268  8e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  53.11 
 
 
280 aa  268  8.999999999999999e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2252  2,5-didehydrogluconate reductase  51.15 
 
 
291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202758  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0343  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  49.07 
 
 
275 aa  265  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4383  aldo/keto reductase  51.66 
 
 
283 aa  265  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1938  2,5-didehydrogluconate reductase  49.45 
 
 
283 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1984  2,5-didehydrogluconate reductase  49.45 
 
 
283 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062143  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03850  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  50.74 
 
 
282 aa  265  7e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0362  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.35 
 
 
279 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  48.15 
 
 
275 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3423  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  50 
 
 
275 aa  264  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2581  2,5-didehydrogluconate reductase  50.73 
 
 
282 aa  264  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02540  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  48.89 
 
 
279 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2582  aldo/keto reductase  47.23 
 
 
276 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0247931  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.52 
 
 
275 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4205  2,5-didehydrogluconate reductase  47.67 
 
 
279 aa  262  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2688  aldo/keto reductase  50.37 
 
 
278 aa  261  8.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0264526  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1918  2,5-didehydrogluconate reductase  48.71 
 
 
283 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.15 
 
 
275 aa  260  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.41 
 
 
312 aa  259  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  47.21 
 
 
275 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.15 
 
 
275 aa  259  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.78 
 
 
275 aa  259  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0487  aldo/keto reductase  51.33 
 
 
277 aa  259  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1972  2,5-didehydrogluconate reductase  48.93 
 
 
298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.41 
 
 
275 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.41 
 
 
275 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.41 
 
 
275 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3515  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  51.11 
 
 
275 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.944641  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.41 
 
 
275 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3349  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  51.11 
 
 
275 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3340  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  51.11 
 
 
275 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3420  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  51.11 
 
 
275 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.355756  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3414  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  51.11 
 
 
275 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0262  2,5-didehydrogluconate reductase  50.57 
 
 
276 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  47.78 
 
 
275 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0600  2,5-didehydrogluconate reductase  46.04 
 
 
267 aa  254  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3945  aldo/keto reductase  50.18 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>