More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3945 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3945  aldo/keto reductase  100 
 
 		 295 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3009  2,5-didehydrogluconate reductase  68.84 
 
 		 294 aa  404  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000425946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2709  aldo/keto reductase  68.49 
 
 		 304 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14340  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  68.6 
 
 		 299 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3900  aldo/keto reductase  65.62 
 
 		 308 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.835176  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31230  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  66.89 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4126  2,5-didehydrogluconate reductase  65.65 
 
 		 294 aa  381  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4543  2,5-didehydrogluconate reductase  64.85 
 
 		 295 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14610  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  58.76 
 
 		 294 aa  352  5e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3218  aldo/keto reductase  64.16 
 
 		 295 aa  348  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1972  2,5-didehydrogluconate reductase  57.55 
 
 		 298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  54.04 
 
 		 276 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  54.8 
 
 		 270 aa  288  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  52.5 
 
 		 272 aa  281  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  50.71 
 
 		 281 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  49.82 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  52.13 
 
 		 276 aa  265  7e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  49.47 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  49.11 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  47.87 
 
 		 276 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  51.25 
 
 		 280 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1919  2,5-didehydrogluconate reductase  47.87 
 
 		 276 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  47.54 
 
 		 282 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  47.54 
 
 		 282 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  47.52 
 
 		 278 aa  261  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4977  2,5-didehydrogluconate reductase  51.41 
 
 		 294 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15550  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  50.18 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1913  2,5-didehydrogluconate reductase  51.8 
 
 		 278 aa  255  7e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.143661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  46.13 
 
 		 282 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2300  2,5-didehydrogluconate reductase  50.18 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2023  2,5-didehydrogluconate reductase  49.82 
 
 		 278 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  50.35 
 
 		 274 aa  252  6e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  47.87 
 
 		 275 aa  252  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.82 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  47.33 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.82 
 
 		 357 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0362  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.29 
 
 		 279 aa  249  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  46.48 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0684  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  47.33 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3480  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  47.33 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02885  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  47.33 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0687  2,5-didehydrogluconate reductase  47.33 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3190  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  47.33 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  46.64 
 
 		 282 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02835  hypothetical protein  47.33 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  50.18 
 
 		 278 aa  248  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  46.62 
 
 		 275 aa  248  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4383  aldo/keto reductase  46.83 
 
 		 283 aa  248  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4323  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  47.5 
 
 		 275 aa  248  9e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  50 
 
 		 274 aa  248  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  49.65 
 
 		 274 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3297  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.98 
 
 		 275 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.292953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  47.35 
 
 		 276 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1989  aldo/keto reductase  46.44 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000065841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0988  2,5-didehydrogluconate reductase  47.87 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3440  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  47.14 
 
 		 275 aa  246  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  43.11 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.81 
 
 		 275 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4349  2,5-didehydrogluconate reductase  49.64 
 
 		 275 aa  246  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.81 
 
 		 275 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0667  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  47.5 
 
 		 277 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.81 
 
 		 275 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.1 
 
 		 312 aa  245  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0272  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  47.14 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0586  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  47.14 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.1 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.1 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.1 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  47.69 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.45 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.1 
 
 		 275 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  46.1 
 
 		 275 aa  241  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2768  2,5-didehydrogluconate reductase  49.08 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  45.32 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2314  oxidoreductase, chromogranin/secretogranin  46.45 
 
 		 272 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4216  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.43 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3766  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  45.68 
 
 		 281 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1172  2,5-didehydrogluconate reductase  48.38 
 
 		 281 aa  239  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.586801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2028  2,5-didehydrogluconate reductase  48.39 
 
 		 277 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02540  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  48.74 
 
 		 279 aa  238  8e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2581  2,5-didehydrogluconate reductase  46.83 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3423  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  45.91 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2582  aldo/keto reductase  42.05 
 
 		 276 aa  236  4e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0247931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0149  diketogulonate reductase  43.16 
 
 		 275 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.200874  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1641  aldo/keto reductase  47.62 
 
 		 286 aa  234  9e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000276497  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2252  2,5-didehydrogluconate reductase  45.42 
 
 		 291 aa  232  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202758  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  45.04 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0336  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  45.32 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3761  2,5-didehydrogluconate reductase  44.88 
 
 		 276 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0491  aldo/keto reductase  46.79 
 
 		 273 aa  228  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.333273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1051  2,5-didehydrogluconate reductase  45.93 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.191739 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3349  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.43 
 
 		 275 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0727  2,5-didehydrogluconate reductase  41.28 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0743  2,5-didehydrogluconate reductase  41.28 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3340  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.43 
 
 		 275 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3414  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.43 
 
 		 275 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4086  aldo/keto reductase  44.96 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.968066 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3515  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.43 
 
 		 275 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.944641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3420  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.43 
 
 		 275 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.355756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  44.21 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>