More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31230 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_31230  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  100 
 
 
293 aa  592  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4543  2,5-didehydrogluconate reductase  72.85 
 
 
295 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3900  aldo/keto reductase  72.63 
 
 
308 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.835176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4126  2,5-didehydrogluconate reductase  69.66 
 
 
294 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2709  aldo/keto reductase  68.03 
 
 
304 aa  404  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3009  2,5-didehydrogluconate reductase  69.18 
 
 
294 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000425946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14340  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  67.81 
 
 
299 aa  395  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3218  aldo/keto reductase  67.81 
 
 
295 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3945  aldo/keto reductase  66.89 
 
 
295 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14610  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  60.76 
 
 
294 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1972  2,5-didehydrogluconate reductase  59.31 
 
 
298 aa  362  3e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  51.26 
 
 
272 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  53.6 
 
 
276 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  53.6 
 
 
276 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  52.55 
 
 
270 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  51.82 
 
 
281 aa  275  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  53.24 
 
 
274 aa  275  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  49.13 
 
 
278 aa  262  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  48.56 
 
 
279 aa  258  7e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4383  aldo/keto reductase  50.54 
 
 
283 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  49.09 
 
 
275 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1913  2,5-didehydrogluconate reductase  49.11 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.143661  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  48.07 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  48.07 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02540  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  50 
 
 
279 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  49.46 
 
 
280 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  47.37 
 
 
282 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  46.76 
 
 
276 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163279  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1742  2,5-didehydrogluconate reductase  47.6 
 
 
286 aa  248  7e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702522  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4349  2,5-didehydrogluconate reductase  50.54 
 
 
275 aa  248  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0988  2,5-didehydrogluconate reductase  46.62 
 
 
272 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  48.21 
 
 
276 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1796  2,5-didehydrogluconate reductase  46.49 
 
 
286 aa  246  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000313979  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1919  2,5-didehydrogluconate reductase  46.04 
 
 
276 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  47.46 
 
 
275 aa  246  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  47.83 
 
 
276 aa  245  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  46.69 
 
 
281 aa  244  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1051  2,5-didehydrogluconate reductase  47.39 
 
 
286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.191739 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0362  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.39 
 
 
279 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2314  oxidoreductase, chromogranin/secretogranin  45.55 
 
 
272 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.01 
 
 
275 aa  241  7.999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.01 
 
 
357 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  46.04 
 
 
275 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2581  2,5-didehydrogluconate reductase  45.83 
 
 
282 aa  239  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15550  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  46.95 
 
 
282 aa  237  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00501077  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  43.37 
 
 
276 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  47.84 
 
 
278 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4977  2,5-didehydrogluconate reductase  47.12 
 
 
294 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1989  aldo/keto reductase  44.78 
 
 
291 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000065841 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  44.84 
 
 
272 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  47.04 
 
 
274 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  45.09 
 
 
276 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2028  2,5-didehydrogluconate reductase  46.95 
 
 
277 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0166  2,5-didehydrogluconate reductase  51.49 
 
 
283 aa  236  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  41.13 
 
 
276 aa  235  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  44.72 
 
 
282 aa  234  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3480  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  44.24 
 
 
275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02885  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  44.24 
 
 
275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0687  2,5-didehydrogluconate reductase  44.24 
 
 
275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02835  hypothetical protein  44.24 
 
 
275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3190  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  44.24 
 
 
275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3761  2,5-didehydrogluconate reductase  44.64 
 
 
276 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2768  2,5-didehydrogluconate reductase  47.43 
 
 
278 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0684  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  44.24 
 
 
275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2300  2,5-didehydrogluconate reductase  45.68 
 
 
278 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109418 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3297  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  44.24 
 
 
275 aa  232  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.292953 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3809  Aldehyde reductase  42.91 
 
 
283 aa  231  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000126678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4323  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.88 
 
 
275 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1898  2,5-didehydrogluconate reductase  44.78 
 
 
292 aa  231  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2023  2,5-didehydrogluconate reductase  45.32 
 
 
278 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3440  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.88 
 
 
275 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  44.84 
 
 
277 aa  229  6e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4086  aldo/keto reductase  43.37 
 
 
276 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.968066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3980  aldo/keto reductase  45.49 
 
 
283 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.817607  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3498  2,5-didehydrogluconate reductase  41.04 
 
 
374 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2708  2,5-didehydrogluconate reductase  48.04 
 
 
286 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  44.44 
 
 
274 aa  226  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0330  organophosphate reductase  44.4 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.318988 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1087  aldo/keto reductase  43.43 
 
 
288 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1297  2,5-didehydrogluconate reductase  41.95 
 
 
280 aa  225  6e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  42.65 
 
 
274 aa  224  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  43.12 
 
 
275 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1901  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.49 
 
 
289 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037382 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0743  2,5-didehydrogluconate reductase  41.88 
 
 
279 aa  223  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1500  putative oxidoreductase protein  45.77 
 
 
276 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181777  normal  0.869656 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.12 
 
 
275 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0727  2,5-didehydrogluconate reductase  41.88 
 
 
279 aa  223  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3075  2,5-didehydrogluconate reductase  43.49 
 
 
283 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2998  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.49 
 
 
283 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.39 
 
 
312 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4373  2,5-didehydrogluconate reductase  43.98 
 
 
283 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0442  2,5-didehydrogluconate reductase  42.91 
 
 
281 aa  223  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  43.12 
 
 
275 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3423  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.93 
 
 
275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0149  diketogulonate reductase  43.01 
 
 
275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.200874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2688  aldo/keto reductase  45.28 
 
 
278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0264526  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0600  2,5-didehydrogluconate reductase  40.65 
 
 
267 aa  222  6e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1850  2,5-didehydrogluconate reductase  47.1 
 
 
277 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.671813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4216  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.36 
 
 
274 aa  221  9e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296306  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0491  aldo/keto reductase  45.85 
 
 
273 aa  221  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.333273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>