More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1898 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1898  2,5-didehydrogluconate reductase  100 
 
 
292 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0995  aldo/keto reductase  57.73 
 
 
291 aa  365  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000447693  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2998  aldo/keto reductase family oxidoreductase  57.35 
 
 
283 aa  341  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3075  2,5-didehydrogluconate reductase  57.35 
 
 
283 aa  341  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1901  aldo/keto reductase family oxidoreductase  57.61 
 
 
289 aa  339  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1051  2,5-didehydrogluconate reductase  55.6 
 
 
286 aa  338  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.191739 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0330  organophosphate reductase  58.27 
 
 
283 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.318988 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1796  2,5-didehydrogluconate reductase  55.24 
 
 
286 aa  334  7.999999999999999e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000313979  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1742  2,5-didehydrogluconate reductase  54.39 
 
 
286 aa  334  7.999999999999999e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702522  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3809  Aldehyde reductase  55.56 
 
 
283 aa  333  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000126678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0166  2,5-didehydrogluconate reductase  58.61 
 
 
283 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3980  aldo/keto reductase  57.51 
 
 
283 aa  324  9e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.817607  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4373  2,5-didehydrogluconate reductase  55.68 
 
 
283 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0361  2,5-didehydrogluconate reductase  57.35 
 
 
286 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479945  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1800  2,5-didehydrogluconate reductase  52.22 
 
 
282 aa  313  2.9999999999999996e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.195279  hitchhiker  0.00925516 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1361  aldo/keto reductase  54.95 
 
 
285 aa  310  1e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104969  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1641  aldo/keto reductase  49.47 
 
 
286 aa  310  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000276497  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1297  2,5-didehydrogluconate reductase  52.36 
 
 
280 aa  308  6.999999999999999e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0442  2,5-didehydrogluconate reductase  52.92 
 
 
281 aa  304  9.000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2230  aldo/keto reductase  48.92 
 
 
282 aa  296  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2269  aldo/keto reductase  48.92 
 
 
282 aa  296  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0160  aldo/keto reductase  57.84 
 
 
284 aa  294  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.960375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2708  2,5-didehydrogluconate reductase  52.31 
 
 
286 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3785  Aldehyde reductase  50.98 
 
 
267 aa  275  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1087  aldo/keto reductase  48.59 
 
 
288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0966  aldo/keto reductase  51.28 
 
 
292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.283303  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2112  2,5-didehydrogluconate reductase  49.64 
 
 
285 aa  263  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113097 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1475  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  48.84 
 
 
289 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1801  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  48.45 
 
 
289 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  50 
 
 
276 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1799  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  48.84 
 
 
289 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0682871  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1656  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  48.84 
 
 
289 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.116736 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1861  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  48.84 
 
 
289 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0353  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.22 
 
 
289 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.93544 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1088  aldo/keto reductase  51.79 
 
 
292 aa  260  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.207607  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0353  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.84 
 
 
289 aa  259  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0266  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.84 
 
 
289 aa  259  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0333  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.22 
 
 
289 aa  259  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2512  aldo/keto reductase  47.1 
 
 
281 aa  258  8e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.415578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0314  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.84 
 
 
289 aa  257  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0064  2,5-didehydrogluconate reductase  47.5 
 
 
288 aa  256  3e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.750291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  46.33 
 
 
275 aa  253  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.36 
 
 
275 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.59 
 
 
312 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0197  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.97 
 
 
277 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0196  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.97 
 
 
277 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0216  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.97 
 
 
277 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.59 
 
 
275 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.59 
 
 
275 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.59 
 
 
275 aa  248  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.59 
 
 
275 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  47.14 
 
 
276 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0216  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.45 
 
 
277 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0239  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.45 
 
 
277 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.21 
 
 
275 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5104  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.45 
 
 
277 aa  246  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0184  aldo/keto reductase  46.59 
 
 
277 aa  246  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  49.81 
 
 
270 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0222  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.45 
 
 
277 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  45.98 
 
 
275 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.59 
 
 
275 aa  245  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0187  aldo/keto reductase  47.06 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1972  2,5-didehydrogluconate reductase  44.73 
 
 
298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0181  2,5-didehydrogluconate reductase  46.27 
 
 
277 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3498  2,5-didehydrogluconate reductase  44.87 
 
 
374 aa  242  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.77 
 
 
275 aa  242  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1553  aldo/keto reductase  47.55 
 
 
285 aa  241  9e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0600  2,5-didehydrogluconate reductase  45.31 
 
 
267 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  46.88 
 
 
275 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  46.06 
 
 
275 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0196  2,5-didehydrogluconate reductase  45.88 
 
 
277 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4126  2,5-didehydrogluconate reductase  45.39 
 
 
294 aa  238  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15550  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  46.43 
 
 
282 aa  236  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00501077  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02885  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.04 
 
 
275 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0687  2,5-didehydrogluconate reductase  46.04 
 
 
275 aa  236  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02835  hypothetical protein  46.04 
 
 
275 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3190  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.04 
 
 
275 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3480  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.04 
 
 
275 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0684  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.04 
 
 
275 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  45.52 
 
 
276 aa  235  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  44.91 
 
 
279 aa  234  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  41.73 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3297  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  45.66 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.292953 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2522  2,5-didehydrogluconate reductase  44.83 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0538132  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4323  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  45.66 
 
 
275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  44.44 
 
 
282 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3440  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  45.66 
 
 
275 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0350  morphine 6-dehydrogenase  60.87 
 
 
191 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.708797 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  44.44 
 
 
282 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.08 
 
 
357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1476  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.32 
 
 
280 aa  232  5e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0251019  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0149  diketogulonate reductase  44.79 
 
 
275 aa  232  7.000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.200874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  43.7 
 
 
281 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31230  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  44.78 
 
 
293 aa  231  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  45.74 
 
 
274 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0964  aldo/keto reductase  44.79 
 
 
273 aa  231  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.259587  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1326  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  43.97 
 
 
280 aa  231  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000298135  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0272  aldo/keto reductase  47.06 
 
 
281 aa  230  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.199766  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.03 
 
 
275 aa  229  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  43.27 
 
 
276 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>