More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4373 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4373  2,5-didehydrogluconate reductase  100 
 
 
283 aa  589  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3980  aldo/keto reductase  90.11 
 
 
283 aa  518  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.817607  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1051  2,5-didehydrogluconate reductase  69.29 
 
 
286 aa  441  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.191739 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3809  Aldehyde reductase  67.73 
 
 
283 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000126678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0330  organophosphate reductase  62.9 
 
 
283 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.318988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0166  2,5-didehydrogluconate reductase  66.9 
 
 
283 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1742  2,5-didehydrogluconate reductase  62.54 
 
 
286 aa  392  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0361  2,5-didehydrogluconate reductase  69.31 
 
 
286 aa  388  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3075  2,5-didehydrogluconate reductase  60.78 
 
 
283 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2998  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.78 
 
 
283 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0442  2,5-didehydrogluconate reductase  61.57 
 
 
281 aa  377  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1796  2,5-didehydrogluconate reductase  60.99 
 
 
286 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000313979  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1901  aldo/keto reductase family oxidoreductase  61.23 
 
 
289 aa  378  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037382 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1297  2,5-didehydrogluconate reductase  58.33 
 
 
280 aa  354  8.999999999999999e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0160  aldo/keto reductase  63.6 
 
 
284 aa  352  4e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.960375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2112  2,5-didehydrogluconate reductase  61.62 
 
 
285 aa  351  8e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113097 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1800  2,5-didehydrogluconate reductase  56.88 
 
 
282 aa  343  1e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.195279  hitchhiker  0.00925516 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1898  2,5-didehydrogluconate reductase  55.68 
 
 
292 aa  340  2e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2269  aldo/keto reductase  54.77 
 
 
282 aa  338  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2230  aldo/keto reductase  54.77 
 
 
282 aa  338  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1641  aldo/keto reductase  57.84 
 
 
286 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000276497  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2708  2,5-didehydrogluconate reductase  58.87 
 
 
286 aa  334  7.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3785  Aldehyde reductase  59.3 
 
 
267 aa  330  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2512  aldo/keto reductase  55.11 
 
 
281 aa  324  9e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.415578  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1361  aldo/keto reductase  51.99 
 
 
285 aa  304  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104969  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0966  aldo/keto reductase  53.38 
 
 
292 aa  297  1e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.283303  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1088  aldo/keto reductase  53.68 
 
 
292 aa  293  2e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.207607  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0995  aldo/keto reductase  49.63 
 
 
291 aa  292  3e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000447693  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  54.26 
 
 
270 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0216  aldo/keto reductase family oxidoreductase  51.74 
 
 
277 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0239  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  51.74 
 
 
277 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5104  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  51.74 
 
 
277 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0222  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  51.74 
 
 
277 aa  270  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0350  morphine 6-dehydrogenase  63.64 
 
 
191 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.708797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.78 
 
 
275 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  50.39 
 
 
275 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  50.2 
 
 
275 aa  268  7e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0216  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.82 
 
 
277 aa  268  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0197  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.82 
 
 
277 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0196  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.82 
 
 
277 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.61 
 
 
275 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.61 
 
 
275 aa  267  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.61 
 
 
312 aa  267  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.61 
 
 
275 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.61 
 
 
275 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  51.5 
 
 
276 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0196  2,5-didehydrogluconate reductase  50.98 
 
 
277 aa  266  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0184  aldo/keto reductase  49.45 
 
 
277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0187  aldo/keto reductase  50.97 
 
 
277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0181  2,5-didehydrogluconate reductase  50.39 
 
 
277 aa  265  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  50.19 
 
 
276 aa  265  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.61 
 
 
275 aa  265  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  50 
 
 
275 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  50.19 
 
 
275 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.22 
 
 
275 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1801  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  46.43 
 
 
289 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  50.98 
 
 
275 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1475  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  46.07 
 
 
289 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  49.42 
 
 
274 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  50.76 
 
 
272 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1799  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  45.71 
 
 
289 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0682871  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1656  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  45.71 
 
 
289 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.116736 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1861  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  45.71 
 
 
289 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0353  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.79 
 
 
289 aa  254  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.93544 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0353  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.79 
 
 
289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0266  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.79 
 
 
289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0333  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.79 
 
 
289 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4126  2,5-didehydrogluconate reductase  47.41 
 
 
294 aa  252  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6724  2,5-didehydrogluconate reductase  50.39 
 
 
277 aa  252  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.658132 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0314  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.43 
 
 
289 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0064  2,5-didehydrogluconate reductase  47.53 
 
 
288 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.750291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3900  aldo/keto reductase  46.95 
 
 
308 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.835176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0600  2,5-didehydrogluconate reductase  46.15 
 
 
267 aa  249  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  49.22 
 
 
276 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  47.29 
 
 
276 aa  248  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14610  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  46.04 
 
 
294 aa  248  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6248  2,5-didehydrogluconate reductase  45.67 
 
 
278 aa  246  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1913  2,5-didehydrogluconate reductase  48.87 
 
 
278 aa  246  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.143661  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  45.36 
 
 
276 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0964  aldo/keto reductase  45.59 
 
 
273 aa  246  4e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.259587  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1972  2,5-didehydrogluconate reductase  45.35 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15550  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  47.99 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00501077  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2522  2,5-didehydrogluconate reductase  44.44 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0538132  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  44.84 
 
 
278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  48.86 
 
 
281 aa  242  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1087  aldo/keto reductase  44.29 
 
 
288 aa  241  7e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4893  2,5-didehydrogluconate reductase  49.24 
 
 
279 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3009  2,5-didehydrogluconate reductase  45.19 
 
 
294 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000425946 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2028  2,5-didehydrogluconate reductase  45.69 
 
 
277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3423  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.23 
 
 
279 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.681639  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  48.09 
 
 
276 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0038  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.28 
 
 
279 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000134419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  45.11 
 
 
282 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0149  diketogulonate reductase  46.27 
 
 
275 aa  238  8e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.200874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5206  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.46 
 
 
279 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3945  aldo/keto reductase  44.69 
 
 
295 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.22 
 
 
357 aa  236  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31230  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  43.98 
 
 
293 aa  237  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02540  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  44.6 
 
 
279 aa  236  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3101  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.46 
 
 
279 aa  236  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>