More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2688 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2688  aldo/keto reductase  100 
 
 
278 aa  564  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0264526  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14880  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  61.4 
 
 
280 aa  336  1.9999999999999998e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00385418  normal  0.25343 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0826  aldo/keto reductase  55.23 
 
 
283 aa  322  5e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0070  aldo/keto reductase related protein  54.87 
 
 
283 aa  321  9.999999999999999e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1866  aldo/keto diketogulonate reductase  55.47 
 
 
282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0868  aldo/keto reductase  54.95 
 
 
280 aa  301  8.000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4977  2,5-didehydrogluconate reductase  54.04 
 
 
294 aa  284  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0791  aldo/keto reductase related protein  46.72 
 
 
277 aa  282  4.0000000000000003e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.451255  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4075  aldo/keto reductase  51.49 
 
 
277 aa  275  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  50.73 
 
 
276 aa  269  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  51.09 
 
 
274 aa  268  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  48.68 
 
 
272 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  51.48 
 
 
278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  49.63 
 
 
276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2618  aldo/keto reductase  50.18 
 
 
274 aa  265  8e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  51.1 
 
 
281 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4205  2,5-didehydrogluconate reductase  50 
 
 
279 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  50.38 
 
 
270 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  49.25 
 
 
276 aa  261  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2300  2,5-didehydrogluconate reductase  50.37 
 
 
278 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2023  2,5-didehydrogluconate reductase  50 
 
 
278 aa  259  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2768  2,5-didehydrogluconate reductase  48.92 
 
 
278 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  50 
 
 
279 aa  259  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  48.53 
 
 
274 aa  257  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.89 
 
 
275 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  48.33 
 
 
276 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  46.27 
 
 
276 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  44.44 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  51.09 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  46.3 
 
 
276 aa  251  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.53 
 
 
357 aa  250  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2582  aldo/keto reductase  47.27 
 
 
276 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0247931  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0685  2,5-didehydrogluconate reductase  44.57 
 
 
281 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  49.82 
 
 
280 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1172  2,5-didehydrogluconate reductase  48.85 
 
 
281 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.586801  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1913  2,5-didehydrogluconate reductase  48.9 
 
 
278 aa  249  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.143661  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.09 
 
 
275 aa  248  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  44.8 
 
 
275 aa  248  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1938  2,5-didehydrogluconate reductase  45.79 
 
 
283 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1984  2,5-didehydrogluconate reductase  45.79 
 
 
283 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062143  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02540  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  47.45 
 
 
279 aa  248  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4086  aldo/keto reductase  47.06 
 
 
276 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.968066 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1972  2,5-didehydrogluconate reductase  46.62 
 
 
298 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.73 
 
 
275 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.68 
 
 
312 aa  247  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.73 
 
 
275 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  43.73 
 
 
275 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4216  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  45.39 
 
 
274 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296306  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  43.73 
 
 
275 aa  246  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.73 
 
 
275 aa  246  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3761  2,5-didehydrogluconate reductase  45.39 
 
 
276 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  47.06 
 
 
276 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163279  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1919  2,5-didehydrogluconate reductase  47.06 
 
 
276 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1918  2,5-didehydrogluconate reductase  45.42 
 
 
283 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  44.09 
 
 
275 aa  245  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  43.73 
 
 
275 aa  244  9e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00820  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  43.38 
 
 
276 aa  244  9e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1500  putative oxidoreductase protein  49.81 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181777  normal  0.869656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4323  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  44 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02885  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  44 
 
 
275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0687  2,5-didehydrogluconate reductase  44 
 
 
275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  45.79 
 
 
277 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02835  hypothetical protein  44 
 
 
275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3480  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  44 
 
 
275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0684  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  44 
 
 
275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3190  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  44 
 
 
275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0262  2,5-didehydrogluconate reductase  47.86 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3297  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.64 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.292953 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3440  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  44 
 
 
275 aa  242  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0362  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.86 
 
 
279 aa  241  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4361  aldo/keto reductase  47.31 
 
 
287 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00197873  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  46.49 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3604  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  44.49 
 
 
281 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0336  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  42.7 
 
 
275 aa  239  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  44.77 
 
 
282 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  44.77 
 
 
282 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  44.77 
 
 
282 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  42.32 
 
 
274 aa  238  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0835  aldo/keto reductase  44.93 
 
 
281 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.600409 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2314  oxidoreductase, chromogranin/secretogranin  45.93 
 
 
272 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0667  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  44.69 
 
 
277 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2581  2,5-didehydrogluconate reductase  46.4 
 
 
282 aa  236  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  42.64 
 
 
276 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0272  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  44.12 
 
 
277 aa  235  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  45.9 
 
 
272 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0343  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  42.34 
 
 
275 aa  235  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  44.53 
 
 
278 aa  234  8e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0988  2,5-didehydrogluconate reductase  45.93 
 
 
272 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0586  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  44.32 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  45.26 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0487  aldo/keto reductase  46.69 
 
 
277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  43.45 
 
 
275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4349  2,5-didehydrogluconate reductase  45.79 
 
 
275 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15550  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  46.62 
 
 
282 aa  232  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00501077  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3766  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  41.7 
 
 
281 aa  231  8.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  42.7 
 
 
275 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3423  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  42.75 
 
 
275 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4126  2,5-didehydrogluconate reductase  45.35 
 
 
294 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  42.55 
 
 
281 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4383  aldo/keto reductase  45.05 
 
 
283 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>