More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4361 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008538  Arth_4361  aldo/keto reductase  100 
 
 
287 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00197873  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2618  aldo/keto reductase  55.97 
 
 
274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1172  2,5-didehydrogluconate reductase  53.96 
 
 
281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.586801  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4075  aldo/keto reductase  53.36 
 
 
277 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  49.44 
 
 
270 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  47.57 
 
 
276 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4086  aldo/keto reductase  45.35 
 
 
276 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.968066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3761  2,5-didehydrogluconate reductase  45.35 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2300  2,5-didehydrogluconate reductase  46.82 
 
 
278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  47.91 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0262  2,5-didehydrogluconate reductase  45.9 
 
 
276 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2023  2,5-didehydrogluconate reductase  46.44 
 
 
278 aa  252  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  46.79 
 
 
278 aa  251  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  44.06 
 
 
276 aa  251  9.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4977  2,5-didehydrogluconate reductase  46.56 
 
 
294 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  47.67 
 
 
274 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  45.93 
 
 
280 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  45.26 
 
 
276 aa  246  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  47.74 
 
 
279 aa  244  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0487  aldo/keto reductase  43.49 
 
 
277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2688  aldo/keto reductase  47.31 
 
 
278 aa  241  9e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0264526  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  43.84 
 
 
281 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  44.96 
 
 
274 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0265  aldo/keto reductase  46.84 
 
 
282 aa  238  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0336  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  42.86 
 
 
275 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  43.54 
 
 
279 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0988  2,5-didehydrogluconate reductase  44.19 
 
 
272 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1500  putative oxidoreductase protein  45.21 
 
 
276 aa  235  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181777  normal  0.869656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1918  2,5-didehydrogluconate reductase  43.87 
 
 
283 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2314  oxidoreductase, chromogranin/secretogranin  44.19 
 
 
272 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0343  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  42.49 
 
 
275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  42.44 
 
 
281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  44.72 
 
 
274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  41.61 
 
 
282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  42.91 
 
 
282 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2768  2,5-didehydrogluconate reductase  45.59 
 
 
278 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  42.91 
 
 
282 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  41.79 
 
 
276 aa  232  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.22 
 
 
275 aa  232  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1938  2,5-didehydrogluconate reductase  43.49 
 
 
283 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1984  2,5-didehydrogluconate reductase  43.49 
 
 
283 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062143  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  43.61 
 
 
276 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163279  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  43.89 
 
 
282 aa  229  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  41.79 
 
 
282 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  43.56 
 
 
272 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4216  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  42.22 
 
 
274 aa  228  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296306  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  42.96 
 
 
275 aa  228  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  40.45 
 
 
272 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  43.49 
 
 
275 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02835  hypothetical protein  41.79 
 
 
275 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02885  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  41.79 
 
 
275 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0687  2,5-didehydrogluconate reductase  41.79 
 
 
275 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0684  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  41.79 
 
 
275 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.22 
 
 
275 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.61 
 
 
312 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1919  2,5-didehydrogluconate reductase  43.17 
 
 
276 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3190  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  41.79 
 
 
275 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3480  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  41.79 
 
 
275 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  43.85 
 
 
275 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.7 
 
 
357 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4323  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  41.79 
 
 
275 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0070  aldo/keto reductase related protein  40.08 
 
 
283 aa  226  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3297  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  41.79 
 
 
275 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.292953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02540  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  39.78 
 
 
279 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4205  2,5-didehydrogluconate reductase  43.61 
 
 
279 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.85 
 
 
275 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  40.46 
 
 
276 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.85 
 
 
275 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.85 
 
 
275 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.85 
 
 
275 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3423  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  42.65 
 
 
275 aa  225  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3440  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  41.42 
 
 
275 aa  225  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  42.8 
 
 
275 aa  225  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0826  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
283 aa  224  9e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15550  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  40.77 
 
 
282 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00501077  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3766  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  40.29 
 
 
281 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  42.07 
 
 
275 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.85 
 
 
275 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0272  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  42.22 
 
 
277 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0667  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  42.22 
 
 
277 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  42.02 
 
 
276 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0586  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  42.22 
 
 
275 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0362  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.25 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  40.37 
 
 
278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2582  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
276 aa  222  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0247931  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  43.02 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2581  2,5-didehydrogluconate reductase  41.67 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0600  2,5-didehydrogluconate reductase  40.82 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  42.48 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4383  aldo/keto reductase  40.52 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14880  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  42.26 
 
 
280 aa  219  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00385418  normal  0.25343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1989  aldo/keto reductase  41.52 
 
 
291 aa  219  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000065841 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00820  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  40.38 
 
 
276 aa  218  7e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  41.13 
 
 
274 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0868  aldo/keto reductase  41.42 
 
 
280 aa  217  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1913  2,5-didehydrogluconate reductase  40.89 
 
 
278 aa  217  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.143661  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12350  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  42.91 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1972  2,5-didehydrogluconate reductase  39.21 
 
 
298 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12986  oxidoreductase  41.16 
 
 
282 aa  215  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4126  2,5-didehydrogluconate reductase  43.33 
 
 
294 aa  214  9e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>